50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2408 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
156 aa  316  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  78.85 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  77.85 
 
 
154 aa  240  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  77.55 
 
 
154 aa  231  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1706  Ferritin and Dps  66.9 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  60.56 
 
 
153 aa  180  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2460  hypothetical protein  57.45 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2317  hypothetical protein  57.45 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5174  Ferritin Dps family protein  54.61 
 
 
144 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000150976 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  51.06 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2787  Ferritin and Dps  48.94 
 
 
159 aa  137  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  48.94 
 
 
144 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  49.65 
 
 
144 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  49.65 
 
 
144 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  49.65 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  31.21 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  30.77 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  30.77 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
185 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  28.87 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  28.67 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  26.85 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
191 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 
194 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  29.46 
 
 
257 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  26.53 
 
 
187 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  26.76 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  28.99 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  27.27 
 
 
192 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  27.66 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  25.17 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  25.17 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  25.17 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  25.35 
 
 
190 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  25.17 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  25.35 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  25.35 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  25.35 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  25.35 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  25.18 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  23.94 
 
 
177 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  23.94 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2621  Ferritin Dps family protein  27.4 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301078  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  26.62 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  31.13 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  31.13 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  30.61 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  25.9 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  21.71 
 
 
275 aa  40.8  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  26.57 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>