242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1078 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1078  ferritin:bacterioferritin  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000658417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1383  bacterioferritin  96.18 
 
 		 157 aa  312  9e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2113  bacterioferritin  73.89 
 
 		 157 aa  247  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  55.84 
 
 		 159 aa  178  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  57.14 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  54.55 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  54.55 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  53.9 
 
 		 159 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  53.9 
 
 		 159 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  54.49 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  55.19 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  54.43 
 
 		 545 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  52.23 
 
 		 157 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  52.23 
 
 		 157 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  52.23 
 
 		 157 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  54.14 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  54.14 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  52.87 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  55.41 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  50.64 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  54.14 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  51.59 
 
 		 157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  51.92 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0932  bacterioferritin  53.21 
 
 		 157 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  50.32 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4160  bacterioferritin  53.21 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.902453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3897  bacterioferritin  53.21 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  50.65 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  51.63 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  52.87 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3358  bacterioferritin  52.56 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000472947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  50 
 
 		 160 aa  161  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3555  bacterioferritin  52.56 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1111  bacterioferritin subunit 2  52.23 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  51.92 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0957  bacterioferritin  53.85 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.147551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3430  bacterioferritin  52.56 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  51.61 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  50.32 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  51.28 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0990  bacterioferritin  53.85 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000039605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  51.32 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0944  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0982  bacterioferritin  51.28 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0946  bacterioferritin  50.96 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0948  bacterioferritin  50.96 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.811124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  50.96 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  48.72 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  49.68 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  50.65 
 
 		 224 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  49.68 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  48.05 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  49.68 
 
 		 180 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  49.04 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  51.3 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  51.3 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  50.66 
 
 		 159 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  50.65 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2834  bacterioferritin  50 
 
 		 154 aa  155  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517561  normal  0.0403197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  49.03 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  50 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2740  bacterioferritin  47.74 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.464346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0637  bacterioferritin  54.84 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.444791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  49.68 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  50 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2396  bacterioferritin  51.3 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0951105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2230  bacterioferritin  49.36 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  48.41 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  50 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  48.39 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  50.64 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  48.41 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  48.41 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1061  bacterioferritin  54.19 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  48.41 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  48.41 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  48.41 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  47.74 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  50.32 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  47.4 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2873  bacterioferritin  52.23 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>