More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4020 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4020  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 
306 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3978  pseudouridine synthase, RluA family  98.69 
 
 
306 aa  611  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5191  pseudouridine synthase, RluA family  66.32 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000721787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3242  pseudouridine synthase, RluA family  65.88 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  normal  0.607359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2882  RluA family pseudouridine synthase  48.81 
 
 
300 aa  278  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2226  pseudouridine synthase, RluD  50 
 
 
301 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27171  pseudouridine synthase  41.12 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2426  pseudouridine synthase  41.47 
 
 
315 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181942  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2106  pseudouridine synthase  40.21 
 
 
315 aa  195  9e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1633  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.13 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.784854  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  34.9 
 
 
331 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  33.45 
 
 
623 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  35.57 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  34.15 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  34.07 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  34.95 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  34.13 
 
 
316 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  30.74 
 
 
305 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.09 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.53 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  33.68 
 
 
304 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1370  pseudouridine synthase, RluD  33.33 
 
 
352 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  29.39 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 
302 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.51 
 
 
325 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.530574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  32.52 
 
 
304 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.09 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0238  23S rRNA pseudouridine synthase D  31.42 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.846353  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.44 
 
 
300 aa  126  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  32.97 
 
 
302 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01005  23S rRNA pseudouridine synthase D  29.18 
 
 
325 aa  126  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  32.97 
 
 
302 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.97 
 
 
302 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  32.97 
 
 
302 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  32.97 
 
 
302 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.97 
 
 
302 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
302 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  31.54 
 
 
323 aa  125  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.62 
 
 
305 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 
325 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  32.97 
 
 
302 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  32.38 
 
 
315 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  30.66 
 
 
303 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  32.67 
 
 
320 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  32.6 
 
 
302 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  33.21 
 
 
334 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.15 
 
 
308 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.85 
 
 
303 aa  122  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  31.43 
 
 
318 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  30.58 
 
 
325 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  32.23 
 
 
309 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  31.67 
 
 
326 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.03 
 
 
304 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  32.85 
 
 
370 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.05 
 
 
343 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  31.13 
 
 
323 aa  122  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.45 
 
 
303 aa  122  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  32.85 
 
 
370 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  31.21 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  33.45 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  29.39 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.22 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  30.03 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.85 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  31.33 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  31.54 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  33.22 
 
 
329 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1390  pseudouridine synthase, RluA family  29.55 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.45 
 
 
403 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0047  pseudouridine synthase, RluD  37.68 
 
 
295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  30.36 
 
 
319 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  31.96 
 
 
342 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1531  pseudouridine synthase  28.57 
 
 
303 aa  119  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.216028 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0921  pseudouridine synthase, RluA family  31.8 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  31.16 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0087  RluA family pseudouridine synthase  31.79 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.49 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  31.97 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  30.51 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  33.1 
 
 
326 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  36.07 
 
 
578 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.7 
 
 
313 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1520  pseudouridine synthase, RluA family  28.19 
 
 
308 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0252  RluA family pseudouridine synthase  28.63 
 
 
298 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.995369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  29.49 
 
 
350 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0318  RluA  33.63 
 
 
299 aa  117  3e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264747  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0664  23S rRNA pseudouridine synthase D  30.41 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0008107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.67 
 
 
403 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  32.97 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.29 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  31.62 
 
 
305 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  29.87 
 
 
306 aa  116  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2975  23S rRNA pseudouridine synthase D  30.59 
 
 
326 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0427325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  28.04 
 
 
306 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  28.19 
 
 
306 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  31.62 
 
 
305 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1798  pseudouridine synthase, RluA family  30.82 
 
 
349 aa  116  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.13 
 
 
323 aa  116  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  32.49 
 
 
358 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  33.8 
 
 
320 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>