More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5205 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  100 
 
 
268 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  61.33 
 
 
264 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  58.56 
 
 
265 aa  315  6e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  47.66 
 
 
250 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  46.06 
 
 
247 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 
250 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  46.72 
 
 
251 aa  204  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  46.69 
 
 
251 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  44.09 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  41.41 
 
 
254 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  41.41 
 
 
246 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  41.43 
 
 
251 aa  178  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 
249 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  40.15 
 
 
253 aa  168  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  36.73 
 
 
258 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  33.46 
 
 
238 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 
248 aa  116  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  33.46 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 
242 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.97 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  25.77 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  25.77 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  33.76 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.84 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  33.76 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  26.17 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  25.77 
 
 
238 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  26.92 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  31.37 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.34 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  33.1 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  35 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  26.47 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  30.34 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  34.68 
 
 
205 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 
212 aa  62.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 
202 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  33.06 
 
 
205 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  34.03 
 
 
210 aa  62  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  32.92 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 
202 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  31.79 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  30.77 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  32.69 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  27.44 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  25.77 
 
 
242 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  31.95 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 
210 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  34.44 
 
 
210 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  32.06 
 
 
226 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  35.64 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.64 
 
 
205 aa  59.3  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  28.8 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
216 aa  58.9  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  28.95 
 
 
212 aa  58.9  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  29.41 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  35.77 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.39 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  31.29 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  28.03 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  31.08 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2581  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.9 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  31.4 
 
 
244 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  27.88 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  33.08 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>