122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4259 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  100 
 
 
349 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  63.37 
 
 
352 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  62.79 
 
 
352 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  62.61 
 
 
351 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  59.21 
 
 
352 aa  406  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  58.82 
 
 
350 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  42.15 
 
 
376 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.55 
 
 
357 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.63 
 
 
360 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.91 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  30.49 
 
 
359 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  36.16 
 
 
286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  26.33 
 
 
374 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  26.33 
 
 
374 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  27.86 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  27.63 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  29.41 
 
 
410 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  29.41 
 
 
424 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  29.41 
 
 
313 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  29.41 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  29.41 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  29.41 
 
 
426 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  29.41 
 
 
424 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  28.36 
 
 
454 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  26.69 
 
 
349 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  27.9 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  25 
 
 
380 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  25.59 
 
 
393 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  27.17 
 
 
344 aa  96.3  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  25.71 
 
 
364 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  25.08 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.88 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  24.49 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  24.58 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  22.38 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  24.15 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  23.98 
 
 
471 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  26.16 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  26.16 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
343 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  26.16 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  26.56 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  22.49 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  24.87 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  23.17 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  24.4 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  26.72 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  24.63 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  24.15 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  20.31 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  22.36 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  21.76 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  26.03 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.49 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  23.37 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  22.15 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  25.96 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  22.05 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  25.57 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  24.11 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  25.8 
 
 
368 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  24.49 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  25.96 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  23.7 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  26.28 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  24.71 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  24.71 
 
 
353 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
361 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
361 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.03 
 
 
361 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  25.27 
 
 
349 aa  56.2  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  23.7 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  23.7 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.7 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  23.37 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.27 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  24.35 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  24.69 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1703  Fatty acid desaturase  22.26 
 
 
350 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0177181  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4655  Linoleoyl-CoA desaturase  25.66 
 
 
381 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  23.66 
 
 
370 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  20.35 
 
 
335 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  23.3 
 
 
370 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  26.02 
 
 
325 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  24.69 
 
 
349 aa  52.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2554  Fatty acid desaturase  25.44 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  24.62 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3890  fatty acid desaturase  23.89 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1778  fatty acid desaturase  23.94 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  24.16 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  24.5 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1495  fatty acid desaturase  23.1 
 
 
362 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384065  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  23.81 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>