51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3967 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  923    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  52.8 
 
 
456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  52.8 
 
 
456 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  56.4 
 
 
877 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  54.05 
 
 
627 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  52.4 
 
 
537 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  41.33 
 
 
475 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  41.28 
 
 
466 aa  346  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  45.51 
 
 
638 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  45.05 
 
 
405 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  46.84 
 
 
648 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  47.73 
 
 
547 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  47.45 
 
 
384 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  44.24 
 
 
457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  43.95 
 
 
662 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  47.79 
 
 
456 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  35.31 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  45.21 
 
 
456 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  45.21 
 
 
456 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  44.35 
 
 
520 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  41.79 
 
 
450 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  39.78 
 
 
623 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  42.2 
 
 
534 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  45.54 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  39.43 
 
 
438 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  32.58 
 
 
511 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  29.23 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  45.63 
 
 
117 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  33.72 
 
 
464 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  37.3 
 
 
1196 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  48.75 
 
 
1190 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 
1214 aa  70.1  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  22.88 
 
 
902 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  22.88 
 
 
902 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  22.46 
 
 
1932 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.7 
 
 
1161 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.7 
 
 
1161 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  24.3 
 
 
781 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  23.51 
 
 
891 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.81 
 
 
2077 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.51 
 
 
1477 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.19 
 
 
1163 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 
1209 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  21.89 
 
 
1914 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 
1908 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24 
 
 
1190 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  22.03 
 
 
787 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  21.74 
 
 
1367 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 
1164 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1847  hypothetical protein  23.11 
 
 
870 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.277811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>