148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2480 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  100 
 
 
445 aa  919    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  58.64 
 
 
459 aa  546  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  57.93 
 
 
476 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  57.08 
 
 
478 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  56.57 
 
 
490 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  56.42 
 
 
488 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  56.41 
 
 
436 aa  502  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  58.21 
 
 
473 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  52 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  47.95 
 
 
476 aa  428  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  46.4 
 
 
470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  46.21 
 
 
482 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  46.21 
 
 
482 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  46.36 
 
 
477 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  45.68 
 
 
472 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  41.8 
 
 
482 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  40.83 
 
 
462 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  35.03 
 
 
473 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  37.13 
 
 
487 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  36.71 
 
 
491 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  35.53 
 
 
471 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  35.16 
 
 
470 aa  239  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  34.09 
 
 
465 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  34.81 
 
 
481 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  32.47 
 
 
542 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  34.02 
 
 
472 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  31.76 
 
 
493 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  34.57 
 
 
480 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  32.27 
 
 
432 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  32.27 
 
 
473 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  32.27 
 
 
473 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  34.17 
 
 
475 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  32.04 
 
 
473 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  32.04 
 
 
473 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  32.04 
 
 
473 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  32.04 
 
 
473 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  34.46 
 
 
480 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  35.56 
 
 
445 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  31.49 
 
 
798 aa  223  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  32.58 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  32.8 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  35.21 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  32.73 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  32.8 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  35.21 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  35.21 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  31.94 
 
 
480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  34.3 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  32.42 
 
 
479 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  35.57 
 
 
488 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  32.01 
 
 
436 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  32.35 
 
 
478 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  33.77 
 
 
479 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  32.21 
 
 
470 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  32.95 
 
 
478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  34.08 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  31.98 
 
 
484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.97 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  30.56 
 
 
467 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  30.6 
 
 
480 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  32.28 
 
 
465 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  32.75 
 
 
432 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  32 
 
 
438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  30.61 
 
 
437 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  30.02 
 
 
465 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  30.93 
 
 
435 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  30.45 
 
 
461 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  31.04 
 
 
482 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  27.8 
 
 
492 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  30.99 
 
 
447 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  29.35 
 
 
488 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  29.03 
 
 
427 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  31.75 
 
 
421 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  28.04 
 
 
474 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  29.42 
 
 
464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  26.9 
 
 
484 aa  163  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  27.23 
 
 
490 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  26.65 
 
 
462 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  30.24 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.99 
 
 
488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  27.48 
 
 
512 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  29.79 
 
 
479 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  27.05 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  27.45 
 
 
452 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  41.62 
 
 
200 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  26.92 
 
 
451 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  25.85 
 
 
445 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  26.56 
 
 
456 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  26.75 
 
 
449 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  25.32 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  39.8 
 
 
222 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3038  hypothetical protein  27.33 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2989  hypothetical protein  27.88 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  25.06 
 
 
491 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000893  hypothetical protein  25.98 
 
 
435 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4999  hypothetical protein  27.44 
 
 
506 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0433305  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1114  protein of unknown function DUF1254  37.07 
 
 
196 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  23.83 
 
 
466 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  23.58 
 
 
512 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1116  protein of unknown function DUF1254  30.99 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.810485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>