More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0345 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0345  histidine kinase  100 
 
 
861 aa  1690    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
1118 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1021  histidine kinase  33.27 
 
 
1109 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.103758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3802  histidine kinase  42.93 
 
 
1121 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 
851 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  36.06 
 
 
828 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0602  histidine kinase  44.8 
 
 
843 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
1352 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  32.67 
 
 
556 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.74 
 
 
1361 aa  179  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  32.31 
 
 
603 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  32.42 
 
 
548 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1942 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.53 
 
 
1046 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1362 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
1274 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1201 aa  171  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  31.14 
 
 
1161 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1193 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1917 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1193 aa  167  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  30.58 
 
 
1200 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  31.01 
 
 
1937 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
1937 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1936 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
974 aa  163  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
1162 aa  162  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 
975 aa  161  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
687 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 
781 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  29.48 
 
 
613 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1271 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
1013 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
791 aa  157  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  30.13 
 
 
1695 aa  157  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
1356 aa  157  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1896 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
1158 aa  157  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
803 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
1977 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 
1927 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
1165 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
1237 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
853 aa  155  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1954 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
573 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
733 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1195 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
754 aa  152  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 
823 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
989 aa  152  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 
1143 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
882 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
799 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 
927 aa  151  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
995 aa  150  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  27.5 
 
 
1763 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 
771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 
769 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
970 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1313 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 
771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 
771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 
772 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
991 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 
771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
663 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 
771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
656 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
827 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1964 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1142 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
664 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1782 aa  148  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
666 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
666 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
1380 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1603 aa  147  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
569 aa  147  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 
1022 aa  147  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.48 
 
 
923 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
1177 aa  147  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 
858 aa  147  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1141 aa  147  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
1937 aa  147  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
989 aa  147  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
674 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 
1131 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1361 aa  146  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
1137 aa  146  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
977 aa  145  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
763 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
763 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
1002 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 
1160 aa  145  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
1002 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
933 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>