289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0227 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0227  response regulator receiver protein  100 
 
 		 585 aa  1166    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0315  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 582 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0538  response regulator receiver domain-containing protein  41.99 
 
 		 588 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0613  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 649 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0462  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 564 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1841  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 578 aa  326  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1867  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1802  response regulator receiver domain-containing protein  34.86 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0482194 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0779  hypothetical protein  30.02 
 
 		 540 aa  144  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.609123  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17441  hypothetical protein  30.02 
 
 		 558 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09661  hypothetical protein  28.54 
 
 		 551 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.308392  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0203  CheY-like domain-containing protein  24.29 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0793618  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08351  hypothetical protein  23.87 
 
 		 531 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0702953  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1874  hypothetical protein  28.88 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08561  hypothetical protein  31.41 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07861  hypothetical protein  21.36 
 
 		 540 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0763804  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08591  hypothetical protein  37.5 
 
 		 538 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.26664  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0803  hypothetical protein  37.5 
 
 		 538 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.227323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.38 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.49 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 221 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 221 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  27.89 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  28.37 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1141  DNA-binding response regulator  23.23 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.780315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19270  predicted protein  30.51 
 
 		 275 aa  57  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000929015 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_25402  predicted protein  30.51 
 
 		 278 aa  57  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.013853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.89 
 
 		 224 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.36 
 
 		 214 aa  56.2  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 205 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 214 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  25.34 
 
 		 206 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 209 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 213 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.39 
 
 		 217 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  25.48 
 
 		 203 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2342  response regulator receiver  28.93 
 
 		 212 aa  54.7  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2408  two component LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 219 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426941  normal  0.882432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.74 
 
 		 213 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.85 
 
 		 200 aa  53.9  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.47 
 
 		 212 aa  53.9  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  29.32 
 
 		 207 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 227 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 210 aa  53.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 218 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.47 
 
 		 220 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 210 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  24 
 
 		 224 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  23.41 
 
 		 214 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 215 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 210 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  28.99 
 
 		 212 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 219 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.35 
 
 		 222 aa  52  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 224 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 213 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  24.46 
 
 		 211 aa  51.6  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 215 aa  51.2  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 215 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.4 
 
 		 223 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 		 213 aa  51.2  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 223 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.38 
 
 		 217 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.19 
 
 		 235 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4220  response regulator receiver  27.89 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.89842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4590  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.89 
 
 		 244 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  normal  0.147521 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  21.46 
 
 		 210 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  25.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.95 
 
 		 210 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 215 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  23.02 
 
 		 210 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3764  response regulator receiver  26.06 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.321181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 215 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.28 
 
 		 210 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 214 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.06 
 
 		 230 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  23.74 
 
 		 211 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 210 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4860  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.6 
 
 		 236 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.142587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 217 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 228 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  28.43 
 
 		 218 aa  49.7  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4712  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4343  response regulator receiver  28.21 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.46 
 
 		 210 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>