250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2842 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
342 aa  681    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  38.99 
 
 
339 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  38.39 
 
 
339 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.84 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.36 
 
 
342 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.3 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.49 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.49 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 
338 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 
338 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 
338 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.7 
 
 
338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.28 
 
 
340 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  28.9 
 
 
344 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.7 
 
 
338 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.03 
 
 
337 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.94 
 
 
337 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.68 
 
 
344 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  37.91 
 
 
343 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  37.69 
 
 
341 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 
344 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.4 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.84 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.1 
 
 
339 aa  162  7e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.76 
 
 
347 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  35.91 
 
 
340 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.27 
 
 
343 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  37.28 
 
 
337 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.59 
 
 
343 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.61 
 
 
340 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  38.04 
 
 
337 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  35.57 
 
 
351 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.45 
 
 
351 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.82 
 
 
343 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  28.44 
 
 
343 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 
340 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.23 
 
 
341 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  29.51 
 
 
345 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 
345 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.33 
 
 
343 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  35.41 
 
 
337 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.28 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  34.36 
 
 
339 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.86 
 
 
344 aa  152  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.59 
 
 
351 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.81 
 
 
340 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.33 
 
 
343 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  35.07 
 
 
343 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.84 
 
 
347 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  34.83 
 
 
347 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 
352 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  34.83 
 
 
347 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.82 
 
 
344 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  34.83 
 
 
347 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  30.37 
 
 
339 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 
345 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.61 
 
 
348 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  34.03 
 
 
343 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.63 
 
 
343 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.6 
 
 
344 aa  146  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.71 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  31.83 
 
 
372 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 
345 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  31.71 
 
 
348 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  32.34 
 
 
334 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.51 
 
 
355 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.34 
 
 
344 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 
353 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.12 
 
 
350 aa  142  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.03 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.4 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  31.33 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.61 
 
 
354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 
357 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 
343 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 
334 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 
346 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  32.34 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  25.51 
 
 
339 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  25.51 
 
 
339 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
344 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  31.53 
 
 
337 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  30.11 
 
 
350 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 
350 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.97 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 
334 aa  137  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  28.82 
 
 
342 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  29.75 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 
334 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  32.42 
 
 
343 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.59 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  32.65 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  31.23 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>