156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1172 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  778    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  50.52 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  37.98 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  38.42 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  36.96 
 
 		 392 aa  249  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  38.66 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  36.83 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  36.07 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  38.9 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  36.34 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  36.6 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  33.42 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  35.57 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  35.7 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  33.77 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  33.87 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  33.69 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  32.32 
 
 		 378 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  31.38 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  33.59 
 
 		 379 aa  195  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  32.28 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  34.95 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  33.06 
 
 		 376 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  34.41 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  34.93 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  34.2 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  35.74 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  35.36 
 
 		 319 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  35.25 
 
 		 323 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  36.65 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  32.49 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  35.38 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  31.66 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  31.74 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  32.13 
 
 		 261 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  32.13 
 
 		 261 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  32.27 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  32.12 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  32.72 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  31.97 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  31.05 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  31.56 
 
 		 332 aa  106  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  27.57 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  28.73 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  29.89 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  27.84 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  27.45 
 
 		 293 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  27.34 
 
 		 294 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  27.11 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  30.19 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  27.91 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  28.19 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  26.41 
 
 		 293 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  28.18 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.17 
 
 		 618 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  29.87 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  28.51 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  27.3 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  27.84 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  28.94 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  27.67 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  26.16 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  26.64 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  27.97 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  23.39 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  38.13 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  26.03 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  24.91 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  32.73 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3647  protein of unknown function DUF362  32.19 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.01191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  26.67 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  26.69 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  26.59 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  24.79 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  23.79 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  24.19 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  26.42 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0429  hypothetical protein  30 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  43.86 
 
 		 677 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  24.42 
 
 		 263 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2462  hypothetical protein  30.66 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2185  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  39.29 
 
 		 184 aa  50.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1173  electron transport complex protein RnfC  37.31 
 
 		 515 aa  49.7  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1785  hypothetical protein  27.37 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  41.18 
 
 		 790 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2345  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 1143 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.932515  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  41.18 
 
 		 799 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  41.18 
 
 		 809 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  41.18 
 
 		 788 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0182  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.51 
 
 		 194 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1083  NADH dehydrogenase subunit I  38.18 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2708  NADH dehydrogenase I, F subunit  34.25 
 
 		 488 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 		 596 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0126  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  37.18 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  37.25 
 
 		 870 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  39.22 
 
 		 876 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  39.22 
 
 		 884 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>