177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2066 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  80.88 
 
 		 790 aa  1032    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1865  electron transport complex protein RnfC  72.29 
 
 		 731 aa  758    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  100 
 
 		 809 aa  1630    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  90.77 
 
 		 799 aa  1206    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  74.56 
 
 		 846 aa  773    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  90.23 
 
 		 788 aa  1157    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1832  electron transport complex protein RnfC  70.85 
 
 		 880 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  87.82 
 
 		 884 aa  930    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  87.82 
 
 		 884 aa  930    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  68.88 
 
 		 870 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  71.36 
 
 		 793 aa  907    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2558  electron transport complex protein RnfC  66.22 
 
 		 784 aa  712    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0669031 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  87.43 
 
 		 885 aa  928    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  80.79 
 
 		 876 aa  936    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  62 
 
 		 842 aa  714    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  68.15 
 
 		 825 aa  728    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  87.62 
 
 		 888 aa  931    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  48.09 
 
 		 890 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1061  electron transport complex protein RnfC  43.42 
 
 		 659 aa  523  1e-147  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  49.81 
 
 		 916 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2341  electron transport complex protein RnfC  42.22 
 
 		 772 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288695  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  47.28 
 
 		 740 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  47.28 
 
 		 708 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  48.36 
 
 		 735 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  48.36 
 
 		 735 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  43.74 
 
 		 732 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  48.36 
 
 		 735 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0379557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  47.28 
 
 		 740 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  47.28 
 
 		 740 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  47.28 
 
 		 694 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  47.18 
 
 		 676 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  47.28 
 
 		 740 aa  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  47.28 
 
 		 740 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  49.81 
 
 		 737 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  47.94 
 
 		 673 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  48.75 
 
 		 747 aa  499  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1819  electron transport complex protein RnfC  46.49 
 
 		 673 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000614228 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0536  electron transport complex protein RnfC  50.57 
 
 		 773 aa  500  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000392819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  49.4 
 
 		 912 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  50.21 
 
 		 852 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  45.21 
 
 		 716 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2239  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  49.62 
 
 		 703 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000974734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  50.11 
 
 		 609 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  49.33 
 
 		 673 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  49.48 
 
 		 745 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  49.38 
 
 		 788 aa  470  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  36.91 
 
 		 944 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  45.17 
 
 		 698 aa  469  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  45.17 
 
 		 659 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  45.17 
 
 		 698 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19250  electron transport complex protein RnfC  45.14 
 
 		 688 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0736  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  44.68 
 
 		 857 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  45.55 
 
 		 981 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  44.02 
 
 		 523 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  38.29 
 
 		 776 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1173  electron transport complex protein RnfC  42.33 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  45.06 
 
 		 567 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2628  electron transport complex protein RnfC  41.94 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0688  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  44.2 
 
 		 605 aa  389  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0508448  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18920  electron transport complex protein RnfC  45.55 
 
 		 774 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000329645  normal  0.0619935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3234  electron transport complex protein RnfC  42.73 
 
 		 573 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1161  electron transport complex protein RnfC  43.2 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1792  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.77 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0814  electron transport complex protein RnfC  41.36 
 
 		 515 aa  369  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338019 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  43.7 
 
 		 558 aa  366  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  43.56 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3933  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  43.78 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00505107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  44.1 
 
 		 519 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1034  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  41.7 
 
 		 704 aa  359  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2991  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  42.35 
 
 		 481 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2822  electron transport complex, C subunit  43.06 
 
 		 495 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50960  Electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  43.92 
 
 		 496 aa  341  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1081  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  41.51 
 
 		 441 aa  334  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0983161 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  41.65 
 
 		 438 aa  323  7e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  41.11 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.95 
 
 		 503 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.69 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0552147  hitchhiker  0.00321553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.09 
 
 		 435 aa  314  4.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0285  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.83 
 
 		 506 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.51844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  42.17 
 
 		 440 aa  312  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.71 
 
 		 435 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0539  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.65 
 
 		 438 aa  305  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.48 
 
 		 435 aa  304  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14350  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40.05 
 
 		 441 aa  303  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000459992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  40 
 
 		 443 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1310  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.69 
 
 		 441 aa  297  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1529  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.37 
 
 		 441 aa  296  8e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.427394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0065  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.55 
 
 		 448 aa  293  7e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0304  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  37.84 
 
 		 443 aa  291  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.980459 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2593  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.39 
 
 		 440 aa  290  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0988  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.95 
 
 		 441 aa  286  8e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0342  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.27 
 
 		 445 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1733  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.36 
 
 		 435 aa  285  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0269079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.77 
 
 		 437 aa  284  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  35.73 
 
 		 436 aa  281  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1327  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.16 
 
 		 439 aa  277  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000291101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1155  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.37 
 
 		 441 aa  273  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.47563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.28 
 
 		 440 aa  272  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0888227  normal  0.012306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2430  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.13 
 
 		 439 aa  271  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0838  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, A subunit  37 
 
 		 480 aa  270  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0144455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>