111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3115 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  100 
 
 		 339 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  53.98 
 
 		 343 aa  348  9e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  52.79 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  52.79 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  52.79 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  52.79 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  52.79 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  52.79 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  52.79 
 
 		 346 aa  338  8e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  53.39 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  49.85 
 
 		 339 aa  305  7e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  50.15 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  49.55 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  44.54 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  42.48 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  38.3 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  37.9 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  36.6 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  36.31 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  34.52 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  34.13 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  32.73 
 
 		 347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  33.45 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  32.39 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  28.75 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  28.87 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  34.15 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  31.21 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  28.52 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  29.55 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  29.55 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  29.91 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  29.91 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  29.39 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  27.18 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  27.18 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  27.22 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.89 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  26.22 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  28.51 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  25.15 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  25.84 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  26.05 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  25.73 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  26.07 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.36 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  24.84 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  24.03 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  25.39 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40817  predicted protein  23.43 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  25.26 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  25.74 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  20.88 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  27.44 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  23.45 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  28.4 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  23.45 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.51 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  23.66 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  23.41 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  25.51 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  22.73 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4626  GHMP kinase  22.79 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  26.6 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  24.05 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  26.16 
 
 		 387 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  23.59 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  28.14 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  22.4 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  23.62 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  25.55 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  21.86 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  20.85 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  21.26 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  24.8 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  23.8 
 
 		 351 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  24.4 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  22.07 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  23.27 
 
 		 316 aa  50.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  23.64 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  27.16 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  27.16 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  22.84 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  25.28 
 
 		 399 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  23.77 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  24.69 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  28.44 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  24.69 
 
 		 381 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  24.69 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  24.69 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  23.08 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.47 
 
 		 395 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  22.58 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  23.08 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  26.95 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  22.99 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  22.99 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  23.43 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  27.16 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>