203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0750 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
376 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  45.96 
 
 
385 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  44.15 
 
 
373 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  45.68 
 
 
415 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  45.68 
 
 
415 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  45.68 
 
 
415 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  44.06 
 
 
414 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  45.68 
 
 
431 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  44.01 
 
 
414 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  44.01 
 
 
411 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  44.01 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  44.01 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  44.01 
 
 
411 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  44.01 
 
 
411 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  44.01 
 
 
411 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  44.01 
 
 
411 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  43.73 
 
 
391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  42.89 
 
 
415 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  44.01 
 
 
385 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  42.63 
 
 
415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  43.99 
 
 
372 aa  295  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  43.84 
 
 
375 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  43.32 
 
 
370 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  41.64 
 
 
374 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  39.2 
 
 
354 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  38.81 
 
 
355 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  40.74 
 
 
349 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  39.23 
 
 
353 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  38.35 
 
 
354 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  38.81 
 
 
355 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  38.81 
 
 
355 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  38.53 
 
 
355 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  38.81 
 
 
353 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  38.04 
 
 
352 aa  258  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  38.53 
 
 
353 aa  258  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  37.96 
 
 
355 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  38.81 
 
 
355 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  37.19 
 
 
363 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  37.31 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
354 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  37.33 
 
 
376 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  36.26 
 
 
348 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  37.33 
 
 
380 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  36.22 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  36.8 
 
 
380 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  35.7 
 
 
388 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  36.11 
 
 
414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  38.59 
 
 
350 aa  238  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  36.64 
 
 
384 aa  237  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  34.82 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  34.28 
 
 
390 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  36.53 
 
 
376 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  35.06 
 
 
351 aa  232  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  37.82 
 
 
368 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  35.33 
 
 
350 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
376 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  35.03 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  36.11 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  36.02 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  35.77 
 
 
345 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  35.14 
 
 
351 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  33.24 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  33.81 
 
 
354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  34.24 
 
 
412 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  35.71 
 
 
341 aa  189  8e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  33.15 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  32.66 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  32.67 
 
 
414 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  31.09 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  34.35 
 
 
353 aa  182  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  31.44 
 
 
379 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  32.75 
 
 
342 aa  178  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  32.11 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  32.76 
 
 
352 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  30.38 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  31.96 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.6 
 
 
338 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  30.89 
 
 
404 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  30.53 
 
 
365 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  30.06 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  32.58 
 
 
344 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  31.49 
 
 
342 aa  152  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  29.39 
 
 
339 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  31.48 
 
 
348 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  30.37 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  30.37 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  29.71 
 
 
381 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  28.12 
 
 
339 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  30.84 
 
 
367 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  31.37 
 
 
363 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  31.79 
 
 
363 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.66 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 
331 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 
331 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 
331 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 
331 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  32.33 
 
 
331 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  28.78 
 
 
328 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  29.95 
 
 
375 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>