More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0544 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  65.47 
 
 		 306 aa  424  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  63.93 
 
 		 305 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  61.44 
 
 		 306 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  61.64 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  61.89 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  59.34 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  56.72 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  54 
 
 		 303 aa  348  5e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  51.64 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  53.33 
 
 		 303 aa  338  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  52.3 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  51.48 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  51.33 
 
 		 303 aa  332  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  52 
 
 		 303 aa  332  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  49.83 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  49.83 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  49.34 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  49.68 
 
 		 318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  49.34 
 
 		 313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  48.84 
 
 		 305 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  48.68 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  47.52 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  48.36 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  48.18 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  48.03 
 
 		 305 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  46.71 
 
 		 313 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  47.04 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  43.91 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  42.62 
 
 		 304 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  40.53 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  39.67 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  40.4 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  33.02 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.35 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  32.87 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  32.87 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  32.87 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  32.87 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  25.24 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  32.87 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  32.87 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  32.87 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  25.99 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  23.37 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  28.72 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  22.4 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  32.94 
 
 		 403 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  31.94 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  25.73 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  28.57 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  28.15 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  32.79 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  25 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  34.11 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  29.59 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  25.28 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  33.62 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  33.06 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  26.97 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  31.47 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  33.06 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.6 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.91 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  25.86 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  24.22 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  35.34 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  23.45 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  25.38 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  33.33 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  31.97 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  25.99 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  23.81 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  31.45 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  22.92 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  32.95 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  35.51 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  26.62 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.63 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  31.82 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  26.36 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.91 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  27.69 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  29.13 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  26.61 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  23.68 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  27.69 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  33.62 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  28.57 
 
 		 424 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.07 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  24.36 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>