72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0529 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  100 
 
 		 400 aa  837    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  44.86 
 
 		 444 aa  347  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  41.58 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  42.08 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  37.01 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  52.22 
 
 		 233 aa  222  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  45.22 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  42.34 
 
 		 425 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  32.02 
 
 		 215 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  40.88 
 
 		 171 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  40.76 
 
 		 171 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  35.68 
 
 		 219 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  35.84 
 
 		 253 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  31.63 
 
 		 218 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  33.15 
 
 		 216 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 181 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  33.7 
 
 		 216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  31.86 
 
 		 214 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  35.08 
 
 		 219 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  33.51 
 
 		 219 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  29.44 
 
 		 220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  32.98 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  32.98 
 
 		 219 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  29.39 
 
 		 229 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  33.53 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  31.63 
 
 		 218 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  30.43 
 
 		 217 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  31.91 
 
 		 216 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  34.57 
 
 		 183 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  30.05 
 
 		 216 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  33.95 
 
 		 183 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  30.05 
 
 		 216 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  29.39 
 
 		 216 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  32.42 
 
 		 220 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  29.28 
 
 		 211 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  29.39 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  27.27 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  32.79 
 
 		 220 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  33.52 
 
 		 226 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  29.33 
 
 		 238 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  26.25 
 
 		 217 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0408  hypothetical protein  44.71 
 
 		 149 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0357243  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  25.45 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2573  hypothetical protein  33.05 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  24.89 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1019  hypothetical protein  35.58 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  32.38 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0773  cytochrome c, class I  35.23 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3450  cytochrome c, class I  35.63 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  31.78 
 
 		 561 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  29 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  28 
 
 		 327 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  25.26 
 
 		 220 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 		 535 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 		 535 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 		 535 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  26.06 
 
 		 178 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 		 487 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  23.78 
 
 		 179 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.26 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2124  hypothetical protein  32.32 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  27.87 
 
 		 121 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 535 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  32.41 
 
 		 535 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1274  cytochrome c class I  30.26 
 
 		 166 aa  43.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  32.65 
 
 		 112 aa  42.7  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>