More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3838 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3838  sporulation integral membrane protein YtvI  100 
 
 		 344 aa  672    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07720  Sporulation integral membrane protein YtvI  30.81 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  27.16 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1013  hypothetical protein  26.41 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000395023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  26.33 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  25.86 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2924  sporulation integral membrane protein YtvI  28.4 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000157456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  28.77 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2683  sporulation integral membrane protein YtvI  28.37 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0571053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  28.65 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  28.65 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0024  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  28.65 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  28.65 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  28.65 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  28.65 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  28.65 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  27.71 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  27.43 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  28.93 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2429  hypothetical protein  25.85 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  27.65 
 
 		 366 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  25.39 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0985  sporulation integral membrane protein YtvI  27.59 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  27.14 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  24.14 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0779  sporulation integral membrane protein YtvI  27.33 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3703  sporulation integral membrane protein YtvI  24.15 
 
 		 365 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000243637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  24.71 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0189  sporulation integral membrane protein YtvI  21.82 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.8 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2466  sporulation integral membrane protein YtvI  25.08 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.180742  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0628  sporulation integral membrane protein YtvI  26.6 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.56 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0115  sporulation integral membrane protein YtvI  25.07 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00027098  hitchhiker  0.00391046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.79 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.03 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0427  sporulation integral membrane protein YtvI  22.46 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  24.48 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  24.38 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  23.03 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  24.06 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.56 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.39 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.33 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  26.48 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  23.3 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1118  transport protein  23.26 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  28.28 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  28.28 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  21.15 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  26.42 
 
 		 665 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.13 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  22.81 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1173  protein of unknown function UPF0118  31.11 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.08 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1700  hypothetical protein  23.87 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.23154  normal  0.0296077 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2662  sporulation integral membrane protein YtvI  21.41 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  22.61 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1665  hypothetical protein  20.94 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108955  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  22.8 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0585  sporulation integral membrane protein YtvI  26.34 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  22.74 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  24.76 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  21.37 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  21.67 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2891  hypothetical protein  23.46 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0951393  hitchhiker  0.00000885055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  36.11 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  31.78 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  26.14 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.04 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.54 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  24.48 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1693  putative transport protein  24.04 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31551  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  36.84 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.68 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.1 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.68 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.68 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  23.03 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  23.35 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  32.28 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  23.31 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.68 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1354  permease  23.01 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.05 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.66 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  23.55 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  24.51 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  21.9 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0191  PerM family permease  25.72 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.739217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  22.73 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1649  putative transport protein  23.74 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>