218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3340 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3340  HAD family hydrolase  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000100356  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000889  putative phosphatase  39.51 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  27.42 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  24.71 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29407  predicted protein  24.89 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160817  normal  0.108947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  24.8 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.52 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.4 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.44 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  24.23 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  23.96 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  24.49 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.52 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0934  HAD family hydrolase  24.6 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  24.23 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  22.46 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.95 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0787  HAD family sugar phosphatase  27.62 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2311  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase, TIGR01548  22.77 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 226 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  23.83 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_004310  BR0489  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0493  phosphoglycolate phosphatase  27.01 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  26.04 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  23.81 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.66 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  22.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.18 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.01 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0128  phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  27.75 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.2 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  22.69 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  24.18 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.86 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  24.63 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3591  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.55 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  hitchhiker  0.00156423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.26 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  21.25 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.12 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  23.12 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  24.08 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  24.23 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.47 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  24.21 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.63 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  22.99 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  21.46 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  24.72 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  25.81 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.74 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  23.17 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.96 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  22.31 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  22.89 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  22.89 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  22.89 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  21.54 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  22.89 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  22.89 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  24.1 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  22.89 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 468 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2234  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.563383  hitchhiker  0.0000000171461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  22.89 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  24.61 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  23.86 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  20.83 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  21.43 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  22.28 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.58 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.85 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  23.26 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  23.26 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.13 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  23.35 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  22.13 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  20.75 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  34.18 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  34.18 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  23.35 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  22.51 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  26.74 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.03 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>