102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3002 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 488 aa  993    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  34.22 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  36.15 
 
 		 286 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  40 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  35.11 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 224 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  32.67 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  33.8 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  36.62 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  37.36 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  31.67 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  33.83 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  35 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  35.25 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 185 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.12 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  32.8 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  42.35 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.52 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.52 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  29.52 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.52 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  29.37 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  32.65 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  28.46 
 
 		 200 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  37.08 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  28.92 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  35.25 
 
 		 163 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  33.05 
 
 		 267 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.41 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.63 
 
 		 259 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  34.13 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.41 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.41 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  32.2 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  34.13 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  34.72 
 
 		 200 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  32.2 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  28.57 
 
 		 242 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  34.13 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  34.13 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  32.79 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.94 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  35.71 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 231 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  30.08 
 
 		 216 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  33.9 
 
 		 239 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 1049 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  27.54 
 
 		 179 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  27.2 
 
 		 189 aa  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  28.78 
 
 		 239 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  35.16 
 
 		 1067 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  30 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  44.07 
 
 		 165 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  34.41 
 
 		 234 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.8 
 
 		 907 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  33.86 
 
 		 197 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  29.41 
 
 		 400 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 460 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  31.54 
 
 		 969 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  32.23 
 
 		 240 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  32.23 
 
 		 240 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  31.45 
 
 		 496 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0640  peptidase M23B  25.41 
 
 		 386 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000535366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  27.61 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0610  peptidase M23B  27.83 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000136568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  31.25 
 
 		 242 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  28.86 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  40.38 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  26.92 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.83 
 
 		 1284 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  24.41 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  39.36 
 
 		 261 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  31.45 
 
 		 228 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3295  cell wall hydrolase SleB  32.32 
 
 		 188 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154024  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  31.06 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  24.58 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  31.97 
 
 		 253 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  24.41 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  24.41 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  24.41 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  32.48 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  24.54 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  24.41 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  25.2 
 
 		 603 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.32 
 
 		 1776 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  24.41 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  25.2 
 
 		 603 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.41 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  27.64 
 
 		 235 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  29.6 
 
 		 153 aa  44.3  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>