More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1637 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  49.76 
 
 		 212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 211 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35.86 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2405  transcriptional regulator GntR  33.01 
 
 		 250 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.146644  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 249 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 253 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0537  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 248 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00104238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17540  transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 237 aa  84.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.74 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.52 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.17 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>