More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1138 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 140 aa  290  4e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  55.2 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  48.91 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 525 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  34.92 
 
 		 565 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  34.78 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  36.36 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  39.73 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.95 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  32.11 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.98 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  33.72 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  32.48 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33.86 
 
 		 316 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  34.88 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.88 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  31.85 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  34.51 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  30.37 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  30.36 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  32.71 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  29.36 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  29.36 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  37.5 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  31.5 
 
 		 316 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  31.78 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  29.84 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  30.09 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  31.78 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  31.85 
 
 		 352 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  32.91 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  32.91 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.53 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  32.91 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  29.9 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  32.91 
 
 		 334 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  29.37 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  32.91 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  32.91 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  32.91 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.07 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  35 
 
 		 314 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1196  mutator MutT protein  30.66 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  49.06 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  31.13 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  31.13 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3077  phosphohydrolase  32.04 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.848469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  53.49 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2839  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  33.01 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00481979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  53.49 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  29.46 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  28.97 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2799  MutT/Nudix family protein  32.04 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 		 154 aa  50.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  27.01 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  28.7 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  29.91 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>