125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0281 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 348 aa  723    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  56.42 
 
 		 345 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  48.37 
 
 		 350 aa  346  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  50.6 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  46.45 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  40.38 
 
 		 329 aa  246  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  40.43 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  22.09 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.29 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  21.78 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  22.36 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.53 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  21.32 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  24.91 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  20.93 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  23.26 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  22.07 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  21.74 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  23.3 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.36 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.77 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5654  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.5 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.37 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  24.54 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  20.44 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.5 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.5 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.49 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.5 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.5 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.5 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.5 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  21.77 
 
 		 329 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.31 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  21.91 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.19 
 
 		 458 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 357 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  21.2 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  21.59 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  22.59 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  22.07 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  20.52 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.3 
 
 		 361 aa  50.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  22.26 
 
 		 388 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  22.26 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 		 340 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  21.47 
 
 		 517 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  20.43 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  21.9 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.641975 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5534  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  22.43 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  24.57 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  21.09 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  19.74 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  19.74 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  19.74 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2881  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like  24.09 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.4 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.4 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  19.74 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  18.86 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.75 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  21.17 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.06 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  22.33 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1978  lipopolysaccharide heptosyltransferase II rfaC2  21.71 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  19.44 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  20.85 
 
 		 418 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.14 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  20.89 
 
 		 340 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  19.73 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  21.94 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3215  glycosyl transferase family 9  21.43 
 
 		 345 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.197224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.25 
 
 		 353 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.98 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  25.08 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  20.54 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  20.54 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  25.81 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  21.14 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  20.21 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  21.1 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  20.85 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>