117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0360 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
369 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  51.47 
 
 
347 aa  369  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  54.05 
 
 
350 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  50.74 
 
 
345 aa  358  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  50.6 
 
 
348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  40.63 
 
 
329 aa  236  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  40.38 
 
 
360 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.13 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.13 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.13 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.13 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.49 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  23.49 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.49 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.49 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.11 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.74 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  20.39 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  23.94 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  23.64 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  21.49 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.96 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  22.48 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.07 
 
 
516 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.01 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.01 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.01 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.01 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.01 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  22.01 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 
404 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 
475 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.41 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  23.68 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  22.6 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.47 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  22.33 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.74 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  21.68 
 
 
394 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.69 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  18.01 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  20.98 
 
 
458 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.79 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  23.95 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.69 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.69 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.69 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  20.69 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  24.03 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  23.7 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  22.01 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
364 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 
379 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
343 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  22.45 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  21.01 
 
 
348 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  20.54 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  20.62 
 
 
326 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  23.64 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0167  glycosyl transferase family 9  21.8 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  20.07 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  20.91 
 
 
362 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  21.58 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  22.05 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  22.67 
 
 
339 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.95 
 
 
368 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  21.77 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  20.62 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
357 aa  50.4  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  21.74 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  23.72 
 
 
341 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1715  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  21.62 
 
 
345 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  22.62 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  22.41 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  20.21 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  22.25 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  22.41 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.2 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3647  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  22.62 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  22.62 
 
 
351 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  21.07 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  22.9 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  18.24 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  22 
 
 
337 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3952  glycosyl transferase family 9  22.04 
 
 
368 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4888  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
331 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20 
 
 
359 aa  46.2  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  22.01 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2103  hypothetical protein  32.05 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  30.77 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  30.77 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  21 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>