33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1663 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  99.43 
 
 		 350 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  97.71 
 
 		 350 aa  710    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  100 
 
 		 350 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2262  hypothetical protein  98.29 
 
 		 350 aa  711    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000276851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2103  hypothetical protein  96.29 
 
 		 350 aa  701    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  34.68 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.641975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  25.3 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  28.43 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  24.24 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  24.1 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.78 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.78 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.63 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.64 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  25.38 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  27.54 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  24.43 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  30.09 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.05 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 369 aa  46.2  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  22.79 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  21.89 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  27.13 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.84 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  21.91 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  23.78 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  27.13 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  21.6 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>