147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1474 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  100 
 
 
347 aa  715    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  51.47 
 
 
369 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  45.93 
 
 
345 aa  330  2e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  49.08 
 
 
350 aa  322  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  46.45 
 
 
348 aa  309  4e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  37.62 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  35.63 
 
 
360 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  21.13 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  22.55 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  24.07 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  24.04 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  21 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.06 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.38 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.68 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  24.62 
 
 
341 aa  61.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1715  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  23.41 
 
 
345 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.73 
 
 
516 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  21 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  22.98 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.08 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.55 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.08 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  20.96 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  18.99 
 
 
347 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 
357 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.61 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.47 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  19.66 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  22.04 
 
 
392 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  17.01 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  19.27 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  21.79 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  22 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.55 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.55 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.55 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.53 
 
 
332 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  20.55 
 
 
376 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  22 
 
 
350 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  22.04 
 
 
404 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  21.73 
 
 
392 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  21.73 
 
 
392 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  22.12 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.55 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  20.61 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.55 
 
 
346 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.13 
 
 
392 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.31 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  22.12 
 
 
349 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  21.18 
 
 
346 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20 
 
 
359 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  19.57 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  18.18 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.21 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  21.2 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.32 
 
 
345 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.32 
 
 
345 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  24.59 
 
 
351 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  19.71 
 
 
341 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  20.66 
 
 
364 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.73 
 
 
360 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  21.89 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  23.18 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  21.36 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  21.41 
 
 
475 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  23.18 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.53 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  21.41 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.06 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  22.37 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  20.32 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  21.48 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.07 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  18.59 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  25.74 
 
 
350 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  20.19 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  19.71 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  22.11 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  21.68 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  18.69 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  20.85 
 
 
363 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  19.39 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  20.86 
 
 
418 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  21.47 
 
 
364 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  21.78 
 
 
418 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  19.46 
 
 
408 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  21.43 
 
 
372 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.68 
 
 
345 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4096  glycosyl transferase family 9  22.62 
 
 
324 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.190613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.35 
 
 
345 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  19.08 
 
 
343 aa  46.2  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  21.56 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  19.16 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.74 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>