192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3104 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
341 aa  667    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  29.82 
 
 
320 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  26.42 
 
 
360 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.641975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0082  Lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.87 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  27.43 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.45 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2827  glycosyl transferase family 9  26.13 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  21.07 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.88 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03310  hypothetical protein  20.3 
 
 
532 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028304  unclonable  1.37732e-21 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  26.35 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  21.65 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.84 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  24.23 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  24.15 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  19.45 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.71 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  18.77 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  18.65 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  22.3 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  21.28 
 
 
359 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  22.34 
 
 
332 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  22.45 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  21.45 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  24.62 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  25.7 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  21.77 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  22.65 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  23.25 
 
 
329 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  22.1 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  23.2 
 
 
348 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  25.3 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  22.65 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  19.68 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  21.57 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  19.86 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.76 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1683  heptosyltransferase family protein  25.84 
 
 
339 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943397  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  22.39 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  18.59 
 
 
392 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  18.59 
 
 
392 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
354 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
354 aa  59.3  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  25.13 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  21.48 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0262  glycosyl transferase family protein  18.55 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  20.95 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  19.2 
 
 
475 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  20.07 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  19.2 
 
 
402 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3934  heptosyltransferase family protein  18.55 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2262  hypothetical protein  24.48 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000276851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  22.55 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  23.89 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  19.68 
 
 
361 aa  57.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.47 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  22.26 
 
 
363 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3091  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  23.03 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  20.22 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3947  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  19.55 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2341  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
390 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3691  heptosyltransferase family protein  18.24 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2103  hypothetical protein  23.96 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.59 
 
 
350 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.98 
 
 
348 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.98 
 
 
348 aa  56.2  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  22.98 
 
 
348 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  19.02 
 
 
404 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  22.44 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.72 
 
 
356 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.98 
 
 
348 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  20.07 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.93 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 
406 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  20.27 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  20.27 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.38 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  19.3 
 
 
779 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  22.49 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.38 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  20.73 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>