48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0338 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  100 
 
 		 320 aa  652    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  29.82 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  24.45 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0082  Lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  24.58 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  21.08 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  19.34 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  23.26 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  21.53 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.641975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  22.89 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20.06 
 
 		 352 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1688  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  24.1 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  24.1 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  24.1 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.9 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  19.26 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  21.88 
 
 		 779 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2103  hypothetical protein  23.35 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2262  hypothetical protein  23.35 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000276851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.08 
 
 		 359 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  25.33 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  23.87 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  18.35 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  19.87 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  21.92 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 357 aa  45.8  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.27 
 
 		 336 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  22.22 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  22.18 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  22.41 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  22.41 
 
 		 373 aa  44.3  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  20 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.75 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  20.77 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  20.75 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3215  glycosyl transferase family 9  21.2 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.573457  normal  0.197224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3391  glycosyl transferase family protein  18.95 
 
 		 409 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06145  hypothetical protein  21.17 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.871394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>