33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2262 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  98.29 
 
 
350 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  97.14 
 
 
350 aa  706    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2262  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000276851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2103  hypothetical protein  98 
 
 
350 aa  713    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  98.29 
 
 
350 aa  711    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  35.48 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.641975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  24.48 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  28.43 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  25 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2415  glycosyl transferase family protein  21.92 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000869235  hitchhiker  0.0000149362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.32 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  25.78 
 
 
351 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  22.29 
 
 
320 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00459  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  24.63 
 
 
359 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  25.78 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  24.09 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  24.09 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  23.66 
 
 
374 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  26.52 
 
 
345 aa  46.6  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  27.1 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  27.54 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
472 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  28.05 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
336 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 
348 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0012  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0568378  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  27.91 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  27.19 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  26.74 
 
 
408 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  27.91 
 
 
349 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  23.78 
 
 
347 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>