30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3351 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  100 
 
 		 360 aa  724    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.641975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  26.42 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  23.82 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2262  hypothetical protein  35.48 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000276851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2103  hypothetical protein  35.48 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1145  hypothetical protein  34.68 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327893  hitchhiker  0.0000000362353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  34.68 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1663  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  34.68 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  22.09 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  21.29 
 
 		 394 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0281  glycosyl transferase family 9  22.22 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  22.37 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  23.34 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03310  hypothetical protein  24.16 
 
 		 532 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028304  unclonable  1.37732e-21 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  23 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  28 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  22.67 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  21.99 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  22.67 
 
 		 351 aa  46.2  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  27.78 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  24.17 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2557  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  23.18 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  21.34 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0386  glycosyl transferase family 9  24.26 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  20.66 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  20.71 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.67 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.22 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>