23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4076 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 394 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0082  Lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  22.55 
 
 		 357 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  20.36 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  22.55 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  28.46 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3351  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  21.29 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.641975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  20.61 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  21.34 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.76 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.36 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  21.2 
 
 		 347 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0354  glycosyl transferase family 9  23.48 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  24.34 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  22.26 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1407  glycosyl transferase family protein  18.54 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  20.46 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  28.3 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  19.93 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.05 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 505 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2822  hypothetical protein  21.6 
 
 		 350 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.434066  normal  0.700436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>