17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0082 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0082  Lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  100 
 
 		 357 aa  731    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4076  putative glycosyl transferase  22.55 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.303015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3104  glycosyl transferase family 9  25.87 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.74 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0338  lipooligosaccharide D-glycero-D-manno-heptosyltransferase  24.92 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.411882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2557  glycosyl transferase family protein  23 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1791  heptosyltransferase  22.19 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  21.31 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1794  heptosyltransferase  28.66 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0140339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.73 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 542 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  44.9 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1707  glycosyl transferase family 9  22.79 
 
 		 322 aa  43.1  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 412 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>