138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1715 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1715  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  100 
 
 
345 aa  703    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3647  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 
352 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  21.65 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.78 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.78 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.78 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.78 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  23.78 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.78 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.78 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.2 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.2 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.2 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.29 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.2 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.2 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.88 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3091  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  23.87 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  21.94 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1776  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0879  glycosyl transferase family 9  24.84 
 
 
327 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000737815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  21.4 
 
 
370 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.38 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1474  heptosyltransferase  23.41 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.379549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.4 
 
 
389 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0473  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.07 
 
 
356 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.189899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.08 
 
 
356 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2230  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 
330 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0384133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  22.64 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.48 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0353  hypothetical protein  27.59 
 
 
241 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.74 
 
 
353 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  22.19 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  21.02 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  22.29 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  22.29 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  21.99 
 
 
372 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.65 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  21.66 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.63 
 
 
516 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  21.65 
 
 
779 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  24.1 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  23.39 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.33 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  42.62 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  20 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  20.62 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  21.07 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
406 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  22.12 
 
 
369 aa  52.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  20.93 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0157  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 
382 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  19.94 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
318 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.36 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2242  heptosyltransferase family protein  21.3 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  21.9 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.97 
 
 
361 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.59 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.59 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.33 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.28 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.81 
 
 
332 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2725  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.756386  normal  0.0898734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3100  glycosyl transferase family 9  40.38 
 
 
324 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.649463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0360  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 
369 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
331 aa  49.7  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  22.19 
 
 
517 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.92 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  36 
 
 
361 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.54 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  19.88 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  21.15 
 
 
361 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3516  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  40.43 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1228  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.63 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1231  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.18 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0852  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  40.43 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3647  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  40.43 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.7 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3214  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.29 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1430  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.67 
 
 
359 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.19 
 
 
359 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  21.22 
 
 
364 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  27.08 
 
 
388 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  22.02 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  20.2 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  35.85 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  16.87 
 
 
350 aa  46.2  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  39.58 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
319 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  24.09 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.9 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.63 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0811  glycosyl transferase family 9  29.33 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
386 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0263  glycosyl transferase family protein  54.55 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>