More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0811 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0811  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 331 aa  675    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1807  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0843  glycosyl transferase family 9  38.18 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0221894 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  33.56 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  43 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  32.39 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  29.78 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.38 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.71 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.8 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.3 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.62 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.48 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.12 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  33.33 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.38 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  36.07 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.65 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.71 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.92 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.71 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3950  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 778 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.35 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  26.06 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4383  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  34.81 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  26.47 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.12 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  24.01 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  33.77 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.26 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.5 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  33.33 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.59 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1385  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.56 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2273  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.56 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0964194  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1297  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.56 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161852  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3038  putative heptosyltransferase  32.56 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3167  putative heptosyltransferase  32.56 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1986  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  32.56 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.36 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  30.38 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  26.53 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  26.09 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2195  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.111352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  26.92 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  34.07 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3925  hypothetical protein  37.04 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1283  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.17 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0326362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.37 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3090  glycosyl transferase family 9  27.33 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1212  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.76 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  35.45 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3193  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.558162  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.81 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  30.63 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  34.29 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  22.15 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.94 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.37 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  31.3 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1009  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  31.98 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  31.11 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  25.61 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  31.9 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  23.67 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  34.35 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0615  glycosyl transferase family 9  37.04 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.016437 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  34.35 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  22.54 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.1 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3077  glycosyl transferase family 9  22.48 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  25.87 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  29.1 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.87 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  34.29 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  28.57 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1257  glycosyl transferase family 9  34.9 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.6 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.85 
 
 		 415 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 368 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  36.29 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  27.75 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  33.11 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  27.82 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  28.24 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  28.45 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>