262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1807 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1807  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
362 aa  735    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0843  glycosyl transferase family 9  35.85 
 
 
420 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0221894 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0811  glycosyl transferase family 9  34.27 
 
 
331 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.41 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  35.8 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.16 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.13 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.13 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.17 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1514  heptosyltransferase family protein  28.09 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  34.86 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  36.13 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3089  glycosyl transferase family 9  23.98 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  26.4 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  29.47 
 
 
362 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  29.59 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  32.26 
 
 
350 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.78 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  37.3 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.51 
 
 
352 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  36.23 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  36.23 
 
 
381 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  26.82 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.52 
 
 
368 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.76 
 
 
360 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  31.03 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.14 
 
 
516 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  27.27 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3628  glycosyl transferase family 9  34.86 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1870  heptosyltransferase family protein  36.16 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.87 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
326 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  34.86 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.69 
 
 
299 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  33.33 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.33 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.33 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.33 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.33 
 
 
340 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.33 
 
 
340 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  34.09 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  33.33 
 
 
352 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  34.09 
 
 
381 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  34.09 
 
 
381 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  34.09 
 
 
381 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  34.09 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  34.09 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  34.09 
 
 
359 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0315  glycosyl transferase family 9  29.32 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.82 
 
 
361 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1824  glycosyl transferase family 9  28.65 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  26.67 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6396  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.210814  normal  0.0991035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  32.52 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5648  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186064  normal  0.149696 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.07 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.07 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  36.27 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0577  heptosyltransferase family protein  28.05 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  29.65 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1968  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  28.05 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.78963  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0576  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.49 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  31.9 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5444  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
358 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00929201 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1164  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.45 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.47 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1633  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
467 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3193  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.558162  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  33.63 
 
 
410 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4359  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114677  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  30.37 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0749  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.481302  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0334  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.67 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0670  ADP-heptoselps heptosyltransferase  28.05 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  34.09 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.43 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2581  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.95 
 
 
332 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0315509  normal  0.0579279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.39 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  27.78 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.82 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.05 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.3 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.39 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2797  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
330 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.31 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1977  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase, putative  36.9 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.29 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.62 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0465  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
415 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.19634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.57 
 
 
367 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.5 
 
 
361 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>