More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3952 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3952  glycosyl transferase family 9  100 
 
 
368 aa  755    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0167  glycosyl transferase family 9  76.02 
 
 
369 aa  547  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1257  glycosyl transferase family 9  44.27 
 
 
375 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  44.35 
 
 
381 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  44.35 
 
 
381 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  44.35 
 
 
381 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  44.8 
 
 
375 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  45.56 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  44.41 
 
 
359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  44.41 
 
 
359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  44.41 
 
 
359 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  44.41 
 
 
359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.65 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1899  glycosyl transferase family 9  29.17 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0607  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  31.54 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  25.07 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1248  glycosyl transferase family 9  25.65 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  36.3 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  36.3 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  28.52 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.18 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2461  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  38.94 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1900  glycosyl transferase family 9  27.6 
 
 
324 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.94 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  36.36 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.8 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1783  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0149  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1791  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0907  glycosyl transferase family 9  34.48 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3111  glycosyl transferase family 9  26.17 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1766  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3715  hypothetical protein  31.9 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.91 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5041  glycosyl transferase family 9  23.41 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.330457  normal  0.05523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  33.83 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  25.25 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  39.25 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.6 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  30.56 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.6 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.6 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  26.6 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0950  glycosyl transferase family 9  35.85 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.74322  normal  0.160962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.75 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.75 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.75 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2637  family 9 glycosyl transferase  38.74 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.75 
 
 
348 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  29.61 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.09 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  26.24 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  27.96 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.3 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.75 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0351  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  39 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  39 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0148  glycosyl transferase family 9  25.17 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5245  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0245525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0079  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.41 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.0000104869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.33 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  23.41 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4133  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.41 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000187228  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1752  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.479662  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  25.89 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.48 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.45 
 
 
516 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.84 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  28.49 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.08 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1567  glycosyl transferase family 9  30.12 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.029243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.35 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  23.43 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>