More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0744 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0744  thymidylate kinase  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.164492  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1246  thymidylate kinase  64.25 
 
 		 192 aa  241  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0268379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0857  thymidylate kinase  63.73 
 
 		 192 aa  240  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0787  thymidylate kinase  64.25 
 
 		 192 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0204299  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1271  thymidylate kinase  48.73 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1126  thymidylate kinase  48.72 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1098  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.456966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0924  thymidylate kinase  49.49 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0893  thymidylate kinase  44.9 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.298263  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1287  thymidylate kinase  41.92 
 
 		 194 aa  144  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.310287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  34.16 
 
 		 209 aa  101  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  31.73 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  33.83 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  31.84 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  32.83 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  30 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  30.69 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  30.66 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  35.9 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  31.82 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  28.71 
 
 		 243 aa  88.6  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  34.69 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  32.23 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  33 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  30.29 
 
 		 219 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  32.85 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  31.84 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  33.33 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  27.32 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  25.85 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  32.56 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  27.05 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  27.23 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  28.64 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  40.16 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  30.43 
 
 		 688 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  30.51 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  32.35 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  35.14 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.43 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  27.86 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2120  thymidylate kinase  35.77 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000730162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  29.33 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  34.13 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  38.1 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01441  thymidylate kinase  31.78 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  30.2 
 
 		 688 aa  78.2  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  31.68 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  28.04 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  32.93 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  32.02 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  26.96 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  24.51 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  31.84 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  32.52 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  32.58 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  33.01 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  29.5 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  27.31 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  29.61 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  34.56 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  25.12 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  28.22 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  28.82 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  27.14 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  27.88 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.96 
 
 		 730 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  27.86 
 
 		 686 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  33.78 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  30.18 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  28.99 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  29.17 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  24.88 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  29.65 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  30.5 
 
 		 707 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  24.63 
 
 		 281 aa  74.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  32.03 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  26.96 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  29.13 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  30.54 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  32.35 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  26.21 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  32.47 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  27.09 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  30.72 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  33.73 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  24.5 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  26.6 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  28.79 
 
 		 901 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  28.16 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>