More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3062 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 318 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  45.3 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  43.57 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  42.95 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  36.06 
 
 		 340 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  41.91 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  39.27 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.24 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.24 
 
 		 276 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.82 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  36.82 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.82 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.82 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.24 
 
 		 276 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.82 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  36.82 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  31.37 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  33.22 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  34.45 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  34.88 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2464  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  33.21 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  31.94 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  33.87 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 275 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 275 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 275 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2459  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0529514  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.87 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  30.83 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.07 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  34.84 
 
 		 275 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  31.85 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.48 
 
 		 273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2159  extracellular solute-binding protein family 3  34.38 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  30.83 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 270 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  36.13 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.51 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  28.96 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  33.63 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  34.1 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.78 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  34.11 
 
 		 290 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0682  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  35.14 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.67 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  32.52 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.48 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  32.35 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.45 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.45 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  30.49 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  32.59 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.65 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.03 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  28.11 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 275 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  29.63 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5673  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.19 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  29.72 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  29.25 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>