More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1978 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  63.39 
 
 
186 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  64.53 
 
 
184 aa  234  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  62.84 
 
 
188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0812  isochorismatase hydrolase  61.2 
 
 
184 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0489  isochorismatase hydrolase  56.59 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2448  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00167941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3564  isochorismatase hydrolase  39.62 
 
 
177 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.247569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5030  isochorismatase hydrolase  40.7 
 
 
186 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0593911  decreased coverage  0.00786893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1174  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 
216 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  37.1 
 
 
185 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 
186 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1652  isochorismatase hydrolase  37.11 
 
 
173 aa  99  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  34.76 
 
 
174 aa  97.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  35.37 
 
 
359 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  33.73 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  33.54 
 
 
359 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2716  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 
183 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  32.93 
 
 
176 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  31.32 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  31.32 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  31.32 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  39.6 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2277  isochorismatase family protein  32.32 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910595 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  29.93 
 
 
164 aa  87.8  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.71 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5755  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
180 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.066854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3819  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
180 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4549  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 
180 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.524921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2135  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  41.91 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  41.3 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1153  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1224  isochorismatase hydrolase  32 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  32.26 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  30.3 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1154  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.399552  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4435  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  37.16 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  37.16 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  37.36 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  37.36 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  37.36 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  37.36 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1847  isochorismatase hydrolase  36.69 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.614848  hitchhiker  0.00000933231 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2347  amidase  30.53 
 
 
164 aa  79  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00237714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  30.72 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3583  isochorismatase family protein  37.36 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.46144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4338  isochorismatase family protein  31.06 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2678  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4391  isochorismatase family protein  30.3 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4231  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0539738  normal  0.306851 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1660  isochorismatase family protein  30.37 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000971288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4278  isochorismatase family protein  30.3 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3999  isochorismatase family protein  30.3 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4009  isochorismatase family protein  30.3 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0367  amidase  32.09 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4160  isochorismatase family protein  30.3 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4372  isochorismatase family protein  31.15 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0862  isochorismatase family protein  31.97 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2926  isochorismatase family protein  35.16 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2275  isochorismatase hydrolase  38.28 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  36.88 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1927  isochorismatase hydrolase  29.68 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.110403  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  31.61 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2348  amidase  24.72 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  38.13 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2042  isochorismatase hydrolase  39.07 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40855  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  36.25 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0419  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.860585  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2883  isochorismatase hydrolase  33.96 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226746  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  34.43 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3602  isochorismatase hydrolase  33.13 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0235  isochorismatase hydrolase  28.32 
 
 
316 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.809907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  32.41 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4420  isochorismatase hydrolase  39.84 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
239 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0445  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
196 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  32.41 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  34.75 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0845  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0614531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  36.25 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42820  isochorismatase family hydrolase  32.39 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>