182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1343 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1343  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.801458  hitchhiker  0.000880887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24870  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  73.17 
 
 		 220 aa  311  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.82834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  76.62 
 
 		 212 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00161655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2435  oligoribonuclease  68.84 
 
 		 211 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0907  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.88 
 
 		 222 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.206307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2655  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  70.81 
 
 		 235 aa  287  8e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2185  oligoribonuclease  66.67 
 
 		 208 aa  284  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000203098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1351  oligoribonuclease  66.32 
 
 		 222 aa  271  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0564  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  66.33 
 
 		 216 aa  271  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.686303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7676  putative oligoribonuclease; K01175  68.21 
 
 		 200 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1649  oligoribonuclease  63.37 
 
 		 269 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.554791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2269  oligoribonuclease  66.85 
 
 		 213 aa  263  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2680  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  69.02 
 
 		 198 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1254  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  68.48 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3716  oligoribonuclease  66.32 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.952269  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19630  N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase  65.26 
 
 		 634 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0180286  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08840  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  61.4 
 
 		 223 aa  254  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0178877  normal  0.0713087 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1081  exonuclease  58.5 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1900  oligoribonuclease  58.91 
 
 		 216 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09680  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  61.98 
 
 		 208 aa  245  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.508062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5970  oligoribonuclease  67.17 
 
 		 213 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1040  oligoribonuclease  59.79 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1056  oligoribonuclease  62.24 
 
 		 208 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0686541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28650  oligoribonuclease (3'->5' exoribonuclease)  61.62 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0552434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5510  oligoribonuclease  60.87 
 
 		 210 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1782  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  54.85 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00227296  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2543  oligoribonuclease  57.36 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4100  oligoribonuclease  56.35 
 
 		 214 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0350683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2012  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  60.77 
 
 		 194 aa  221  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1017  oligoribonuclease  57.73 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1126  oligoribonuclease  57.73 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.499716  normal  0.391456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3640  oligoribonuclease  55.9 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00635145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3713  oligoribonuclease  55.9 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3645  oligoribonuclease  55.9 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1466  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  57.92 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12533  oligoribonuclease  55.1 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1339  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.76 
 
 		 198 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1425  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  56.91 
 
 		 191 aa  204  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  47.19 
 
 		 181 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  46.63 
 
 		 181 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2426  oligoribonuclease  46.07 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.142908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.28 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0863  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.49 
 
 		 188 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.859258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00920  oligoribonuclease  45.79 
 
 		 194 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0529998  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  44.27 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  42.33 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.02 
 
 		 188 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0633  oligoribonuclease  44.94 
 
 		 184 aa  158  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.840198  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1552  oligoribonuclease  43 
 
 		 195 aa  157  9e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145931  normal  0.275073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  44.38 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  44.89 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1734  oligoribonuclease  42.5 
 
 		 195 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0026371  normal  0.333729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  43.02 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  43.96 
 
 		 181 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  43.39 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  47.65 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  47.65 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  42.7 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  44.81 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  42.22 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  42.22 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  42.46 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  42.22 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  42.53 
 
 		 184 aa  154  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  42.7 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  43.43 
 
 		 180 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0811  oligoribonuclease  42.86 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0543642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  40.78 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  45.71 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  45.71 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  45.98 
 
 		 180 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  44.25 
 
 		 181 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  45.14 
 
 		 180 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  43.89 
 
 		 181 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3753  oligoribonuclease  43.18 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.18 
 
 		 183 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1379  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 183 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.969782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  42.13 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1320  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 183 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.255771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  43.75 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.57 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  45.3 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  43.33 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  41.34 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.46 
 
 		 180 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1700  oligoribonuclease  45.51 
 
 		 187 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.104292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  43.58 
 
 		 181 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>