More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10880 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10880  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  100 
 
 
357 aa  719    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2466  peptidase M50  61.28 
 
 
364 aa  439  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23570  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  54.65 
 
 
356 aa  381  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.127654  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0712  peptidase M50  34.84 
 
 
456 aa  106  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41926  hitchhiker  0.0000525349 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.3 
 
 
351 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  27.22 
 
 
355 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  27.93 
 
 
367 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.89 
 
 
385 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  27.53 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  25.45 
 
 
370 aa  86.3  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0005  peptidase M50  33.33 
 
 
250 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.27 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1230  peptidase M50  32.2 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.704176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  27.15 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  22.98 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  26.2 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1573  peptidase M50  31.82 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.42 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  41.49 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.61 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  24.33 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.4 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  27.7 
 
 
417 aa  72.8  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  27.08 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  26.26 
 
 
386 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  26.26 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  51.35 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  44.71 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3624  peptidase M50  28.51 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.670502  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.36 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.79 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.24 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11310  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  27.83 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.79 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.04 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.46 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.78 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06930  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  29.3 
 
 
455 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.21 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.17 
 
 
428 aa  67  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10210  predicted membrane-associated Zn-dependent protease  27.2 
 
 
447 aa  67  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.818743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  26.6 
 
 
420 aa  67  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  44.58 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  44.58 
 
 
375 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.67 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.89 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2836  putative membrane-associated zinc metalloprotease  45.71 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000950908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  24 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.23 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.54 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.54 
 
 
444 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  42.25 
 
 
438 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  40.96 
 
 
438 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.38 
 
 
368 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  30 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  33.1 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  33.1 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  43.24 
 
 
428 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48723  predicted protein  27.52 
 
 
542 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  42.68 
 
 
451 aa  63.5  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0748  PDZ/DHR/GLGF  26.84 
 
 
450 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0422826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  27.7 
 
 
549 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  27.1 
 
 
417 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  30.53 
 
 
342 aa  62.8  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  44.44 
 
 
495 aa  62.8  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  42.11 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  26.37 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  36.61 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  41.84 
 
 
454 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.86 
 
 
445 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.73 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  41.03 
 
 
430 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  42.17 
 
 
452 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  42.17 
 
 
450 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1428  peptidase M50  34.59 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal  0.609667 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0991  peptidase M50  21.96 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.17 
 
 
450 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.21 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  42.17 
 
 
450 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  37.86 
 
 
558 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  31.47 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.1 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  42.17 
 
 
450 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  30.14 
 
 
466 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.53 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  43.53 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  45.57 
 
 
450 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  26.73 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  38.54 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  29.08 
 
 
456 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5889  peptidase M50  39.76 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  40.28 
 
 
336 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  37.93 
 
 
469 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.77 
 
 
455 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2499  peptidase M50  25.91 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.761739  normal  0.702763 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1412  peptidase M50  25.46 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3974  peptidase M50  44.19 
 
 
454 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.17805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  31.86 
 
 
369 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>