More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48723 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48723  predicted protein  100 
 
 
542 aa  1087    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187612  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  35.23 
 
 
359 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  34.23 
 
 
359 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  36.82 
 
 
369 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2040  membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 
417 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13611  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  33.89 
 
 
359 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  34.27 
 
 
370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  36.13 
 
 
364 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  32.78 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  34.56 
 
 
361 aa  127  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1148  membrane-associated zinc metalloprotease  26.73 
 
 
419 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0330483  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  32.36 
 
 
362 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  34.56 
 
 
361 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0687  membrane-associated Zn-dependent protease  25.7 
 
 
417 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  33.21 
 
 
361 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  33.21 
 
 
361 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  33.7 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3671  membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3561  membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3579  membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3958  membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 
420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3832  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.96 
 
 
418 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.5484300000000005e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1326  RIP metalloprotease RasP  26.71 
 
 
418 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000504967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3918  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.33 
 
 
418 aa  120  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0572  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.09 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.763632  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3867  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
418 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3861  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.33 
 
 
420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  35.53 
 
 
364 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  31.65 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3643  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.3 
 
 
418 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1348  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.44 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1322  putative membrane-associated zinc metalloprotease  22.44 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2472  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.04 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  26 
 
 
373 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  31.1 
 
 
364 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  25.51 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.15 
 
 
441 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  25.89 
 
 
461 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  25.51 
 
 
386 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.59 
 
 
360 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.56 
 
 
361 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  24.47 
 
 
421 aa  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.71 
 
 
366 aa  106  9e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0829  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  22.13 
 
 
428 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0029507  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  27.71 
 
 
453 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  25.56 
 
 
376 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  25.87 
 
 
422 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.74 
 
 
461 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
353 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  25.8 
 
 
369 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0807  membrane-associated Zn-dependent protease 1  25.68 
 
 
418 aa  99.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234706  hitchhiker  0.000000563759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  24.15 
 
 
439 aa  98.6  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.96 
 
 
455 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  23.62 
 
 
438 aa  96.7  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.58 
 
 
448 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  26.43 
 
 
360 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2433  membrane-associated Zn-dependent protease 1  25.49 
 
 
428 aa  96.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  25.8 
 
 
454 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.41 
 
 
457 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  26.02 
 
 
450 aa  94.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0246  membrane-associated Zn-dependent protease 1  24.44 
 
 
420 aa  94.4  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06051  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  32.9 
 
 
360 aa  94  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.68 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.85 
 
 
355 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.79 
 
 
458 aa  93.2  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  29.15 
 
 
348 aa  90.5  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.4 
 
 
419 aa  90.1  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0923796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.2 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  27.54 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.52 
 
 
456 aa  88.6  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7315  membrane-associated Zn-dependent protease 1- like protein  24.06 
 
 
431 aa  88.2  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  25.28 
 
 
443 aa  88.2  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.43 
 
 
456 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  32.43 
 
 
456 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  27.99 
 
 
384 aa  87  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.27 
 
 
455 aa  86.7  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  27.65 
 
 
337 aa  86.7  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.28 
 
 
343 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3203  peptidase M50  24.68 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.43 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.41 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.99 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.25 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.21 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  32.02 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3842  peptidase M50  24.19 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.59 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.92 
 
 
456 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  32.02 
 
 
456 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.47 
 
 
377 aa  83.2  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.89 
 
 
350 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  32.02 
 
 
456 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  26.81 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  33.97 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.94 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.91 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  25.38 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  24.79 
 
 
454 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  24.38 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  29.79 
 
 
342 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>