More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1792 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  100 
 
 
360 aa  691    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0572  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  74.13 
 
 
360 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.763632  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06051  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  67.78 
 
 
360 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  60.06 
 
 
365 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  57.22 
 
 
361 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  57.5 
 
 
361 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  53.89 
 
 
359 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  53.33 
 
 
359 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13611  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  53.89 
 
 
359 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  51.94 
 
 
359 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  49.04 
 
 
364 aa  298  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  46.81 
 
 
362 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  49.71 
 
 
364 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  45.75 
 
 
369 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  46.7 
 
 
364 aa  269  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  44.8 
 
 
363 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  41.62 
 
 
370 aa  257  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  46.36 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  46.36 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.88 
 
 
355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.25 
 
 
357 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.18 
 
 
335 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  33.06 
 
 
386 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.76 
 
 
335 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  33.06 
 
 
386 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.87 
 
 
383 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  33.43 
 
 
367 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.69 
 
 
383 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  35.37 
 
 
353 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.66 
 
 
383 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  32.5 
 
 
386 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.97 
 
 
377 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  30.81 
 
 
354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  31.08 
 
 
354 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.46 
 
 
343 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  31.42 
 
 
383 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  30.98 
 
 
386 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  32.29 
 
 
338 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  30.11 
 
 
383 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.4 
 
 
332 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.16 
 
 
366 aa  149  8e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  30.13 
 
 
377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  31.39 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.33 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.64 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  31.83 
 
 
336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.92 
 
 
361 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  29.38 
 
 
375 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.57 
 
 
372 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  30.59 
 
 
337 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  30.62 
 
 
347 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  29.59 
 
 
373 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.39 
 
 
392 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  32.15 
 
 
354 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  28.35 
 
 
376 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  35.33 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  30.39 
 
 
355 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.2 
 
 
380 aa  139  7e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.14 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  31.16 
 
 
384 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  30.87 
 
 
386 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.61 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.66 
 
 
374 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.44 
 
 
367 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  32.46 
 
 
325 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  32.25 
 
 
356 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  30.46 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  31.47 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  32.04 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.5 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.15 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.62 
 
 
355 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  29.57 
 
 
369 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.73 
 
 
368 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.28 
 
 
368 aa  133  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  31.64 
 
 
367 aa  133  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  29.86 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  29.44 
 
 
370 aa  132  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.48 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  30.17 
 
 
352 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.92 
 
 
379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  25.87 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
342 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  30.64 
 
 
379 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  28.96 
 
 
349 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.49 
 
 
350 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.74 
 
 
353 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0352  peptidase M50  30.2 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.48 
 
 
345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.83 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.25 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  30.68 
 
 
388 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  28.99 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.8 
 
 
355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2836  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.61 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000950908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.65 
 
 
347 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  33.23 
 
 
354 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1043  peptidase M50  30.87 
 
 
372 aa  125  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0249274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  29.68 
 
 
367 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.24 
 
 
351 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>