More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1043 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1043  peptidase M50  100 
 
 
372 aa  734    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0249274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1786  membrane-associated zinc metalloprotease  37.92 
 
 
337 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.250325  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1960  membrane-associated zinc metalloprotease  40.99 
 
 
348 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  33.03 
 
 
341 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.25 
 
 
383 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  33.84 
 
 
383 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  31.74 
 
 
347 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.65 
 
 
347 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.18 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.18 
 
 
383 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.72 
 
 
357 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  27.86 
 
 
338 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.93 
 
 
339 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.12 
 
 
383 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2601  peptidase M50  31.64 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0673098  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  35.75 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  32.18 
 
 
383 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 
386 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  31.88 
 
 
367 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1818  peptidase M50  31.55 
 
 
371 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0171111  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  30.16 
 
 
354 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 
386 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
386 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.37 
 
 
377 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  28.96 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.43 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.97 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.84 
 
 
367 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.86 
 
 
368 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  29.49 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  28.53 
 
 
348 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  30.14 
 
 
356 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.92 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  32.31 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.14 
 
 
351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  29.64 
 
 
342 aa  134  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.16 
 
 
368 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.81 
 
 
374 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.06 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  32.09 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.16 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  30.46 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  32.09 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  27.64 
 
 
380 aa  130  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.53 
 
 
343 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.08 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  32.53 
 
 
354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0534  peptidase M50  31.75 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000573099  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.95 
 
 
392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  31.84 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  31.32 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.8 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  26.25 
 
 
376 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.8 
 
 
353 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.53 
 
 
368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.01 
 
 
345 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  26.63 
 
 
342 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  28.53 
 
 
379 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  29.56 
 
 
353 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  27.81 
 
 
354 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  27.81 
 
 
354 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.43 
 
 
347 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  27.66 
 
 
352 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  28.19 
 
 
369 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  27.17 
 
 
337 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1426  membrane-associated zinc metalloprotease  30.94 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191575  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.68 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  28.49 
 
 
379 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.18 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  27.93 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.32 
 
 
335 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  29.7 
 
 
396 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13611  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  25.75 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  26.37 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  24.46 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.32 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.23 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  23.84 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.7 
 
 
355 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  27.95 
 
 
370 aa  116  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  23.56 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  26.2 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.01 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  32.8 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  27.67 
 
 
369 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5067  membrane-associated zinc metalloprotease  28.31 
 
 
367 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  31.17 
 
 
381 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  26.15 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.25 
 
 
372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2035  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.3 
 
 
379 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  25.14 
 
 
361 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0296  membrane-associated zinc metalloprotease  31.11 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_314  membrane-associated zinc metalloprotease  28.41 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.36 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  27.59 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.62 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2621  membrane-associated zinc metalloprotease  32.19 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0313354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  31.01 
 
 
367 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>