More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3629 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3629  peptidase M50  100 
 
 
325 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  38.11 
 
 
355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000258691  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.63 
 
 
355 aa  205  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  35.14 
 
 
354 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  35.43 
 
 
354 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.33 
 
 
355 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.69 
 
 
372 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  36.03 
 
 
355 aa  192  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0890  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.9 
 
 
343 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000919526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  33.93 
 
 
347 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.39 
 
 
367 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  35.28 
 
 
354 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  34.2 
 
 
354 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  32.77 
 
 
352 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2821  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.37 
 
 
383 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.370481  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.46 
 
 
357 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  32.4 
 
 
355 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3261  membrane-associated zinc metalloprotease  31.11 
 
 
383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0616  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.15 
 
 
339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1234  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.27 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2850  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.83 
 
 
383 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1135  RIP metalloprotease RseP  30.88 
 
 
370 aa  162  7e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  32.23 
 
 
369 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000683327  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  29.12 
 
 
376 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  31.49 
 
 
354 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000133266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  31.09 
 
 
356 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  33.07 
 
 
396 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  28.61 
 
 
370 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2518  zinc metallopeptidase  29.4 
 
 
373 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.436086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  29.97 
 
 
338 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16631  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  34.15 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.24545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4432  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.79 
 
 
385 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0467  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.63 
 
 
377 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0719  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.58 
 
 
366 aa  154  2e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1070  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.3 
 
 
380 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0808  hypothetical protein  33.85 
 
 
361 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.52114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.9 
 
 
347 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1852  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.22 
 
 
383 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0681454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0124  RIP metalloprotease RseP  30.83 
 
 
369 aa  150  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195858  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1953  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.53 
 
 
361 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.667099  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13611  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  31.53 
 
 
359 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.55 
 
 
368 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0623  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.26 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  29.97 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1376  peptidase RseP  30.06 
 
 
373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.273441  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.29 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.03 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1701  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.03 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.581219  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13821  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  30.68 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.34 
 
 
368 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  31.07 
 
 
337 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12761  membrane-associated Zn-dependent protease 1  30.31 
 
 
365 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0131503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  30.99 
 
 
348 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  34.88 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13901  membrane-associated Zn-dependent proteases 1  30.4 
 
 
359 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0366  membrane-associated zinc metalloprotease  29.36 
 
 
367 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  32.91 
 
 
341 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000432825  hitchhiker  0.00000345421 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1042  peptidase RseP  30.38 
 
 
336 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000013997 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1290  hypothetical protein  30.4 
 
 
359 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.62255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3189  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.06 
 
 
392 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2443  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.72 
 
 
383 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  27.45 
 
 
383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.04 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1161  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.63 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472937  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1249  membrane-associated zinc metalloprotease  31.55 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0540521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1181  membrane-associated zinc metalloprotease  31.25 
 
 
351 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1137  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.37 
 
 
374 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.615392  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0860  RIP metalloprotease RseP  30.4 
 
 
370 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0514  membrane-associated zinc metalloprotease  30.48 
 
 
377 aa  136  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.30248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
386 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  29.43 
 
 
349 aa  135  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2558  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.45 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  26.89 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1363  membrane-associated zinc metalloprotease  33.64 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3268  hypothetical protein  31.44 
 
 
364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2042  membrane-associated zinc metalloprotease  30.59 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12605  predicted protein  32.19 
 
 
370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0627411  normal  0.0535145 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1653  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.9 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1532  membrane-associated zinc metalloprotease  28.85 
 
 
386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  26.69 
 
 
375 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.5 
 
 
345 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2728  membrane-associated zinc metalloprotease  30.58 
 
 
362 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0448  hypothetical protein  33.12 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2082  membrane-associated zinc metalloprotease  30.03 
 
 
386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.96 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3836  membrane-associated zinc metalloprotease  28.93 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  29.75 
 
 
386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.65169  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.96 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0932  membrane-associated zinc metalloprotease  28.03 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.115167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3315  membrane-associated zinc metalloprotease  27.51 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000939157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1387  peptidase RseP  29.6 
 
 
379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493232  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5193  membrane-associated zinc metalloprotease  33.65 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000035702 
 
 
-
 
NC_002936  DET0370  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.79 
 
 
345 aa  126  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3440  membrane-associated zinc metalloprotease  29.45 
 
 
384 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.549674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1730  hypothetical protein  30.79 
 
 
364 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1444  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.34 
 
 
377 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1593  peptidase RseP  29.46 
 
 
367 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0572  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.13 
 
 
360 aa  122  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.763632  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2406  membrane-associated zinc metalloprotease  31.6 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738258  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2356  membrane-associated zinc metalloprotease  31.6 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>