More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1729 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  58.72 
 
 		 227 aa  262  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  50.91 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  48.61 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  51.63 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  48.57 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  47.39 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  47.39 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  47.39 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  46.45 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  47.85 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  45.62 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  44.02 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  48.36 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  45.21 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  49.07 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  43.96 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.06 
 
 		 526 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  44.88 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.01 
 
 		 511 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.01 
 
 		 511 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  43 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  46.73 
 
 		 217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.18 
 
 		 529 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  44.81 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  42.38 
 
 		 219 aa  181  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  48.6 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  45.71 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.64 
 
 		 534 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  43.06 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  44.86 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  43.38 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.46 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.06 
 
 		 528 aa  178  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  42.44 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  39.45 
 
 		 539 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  43.84 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0086  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3589  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.577192  normal  0.0958027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  47.57 
 
 		 227 aa  174  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  45.58 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  41.7 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  40.98 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1982  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000405125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  41.9 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  45.5 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1733  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 238 aa  170  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000909322  hitchhiker  0.0092352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  45.89 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.18 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3221  cytidylate kinase  43.06 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  41.9 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 514 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  43.98 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  40.81 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  44.06 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  38.14 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  40.67 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  41.43 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  41.04 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.91 
 
 		 527 aa  165  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  45.66 
 
 		 234 aa  165  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  44.55 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  41.12 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.92 
 
 		 516 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>