More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3998 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
296 aa  593  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.07 
 
 
295 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.33 
 
 
295 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.63 
 
 
301 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.12 
 
 
298 aa  349  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.86 
 
 
292 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.27 
 
 
295 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  56.81 
 
 
297 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.33 
 
 
296 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.63 
 
 
295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  56.9 
 
 
297 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  56.9 
 
 
297 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.33 
 
 
294 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.89 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.24 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.89 
 
 
297 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.05 
 
 
294 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 
294 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.67 
 
 
297 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  54.33 
 
 
297 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.38 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
296 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.05 
 
 
292 aa  258  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.86 
 
 
296 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.36 
 
 
302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.68 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.16 
 
 
294 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  49.15 
 
 
303 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.68 
 
 
298 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 
297 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.44 
 
 
328 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.16 
 
 
297 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 
299 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.54 
 
 
321 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
296 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
296 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.47 
 
 
296 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.18 
 
 
292 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  46.46 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.08 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.8 
 
 
323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  41.55 
 
 
297 aa  212  7.999999999999999e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 
293 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.14 
 
 
289 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  39.6 
 
 
301 aa  202  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
321 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
311 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  35.67 
 
 
316 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
297 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  34.44 
 
 
300 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
307 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.42 
 
 
310 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.47 
 
 
301 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 
295 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
295 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
312 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
319 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 
299 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  32.08 
 
 
329 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  32.4 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  32.08 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  31.34 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  31.58 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3361  hopanoid-associated sugar epimerase  30.6 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  31.22 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.18 
 
 
340 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1057  hypothetical protein  24.43 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.251786  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01610  hypothetical protein  27.95 
 
 
364 aa  63.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.529608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.43 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  28.87 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  26.64 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.2 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  25.27 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.384866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>