More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2812 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3205  prolyl-tRNA synthetase  71.23 
 
 		 439 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1066  prolyl-tRNA synthetase  70.79 
 
 		 441 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1865  prolyl-tRNA synthetase  70.16 
 
 		 439 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102864  normal  0.0772864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4531  prolyl-tRNA synthetase  69.79 
 
 		 444 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1576  prolyl-tRNA synthetase  70.41 
 
 		 435 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.710694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2597  prolyl-tRNA synthetase  70.78 
 
 		 439 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.700725  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2427  prolyl-tRNA synthetase  71.07 
 
 		 439 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0696264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1797  prolyl-tRNA synthetase  69.48 
 
 		 439 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.605201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2865  prolyl-tRNA synthetase  71.23 
 
 		 439 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2197  prolyl-tRNA synthetase  69.93 
 
 		 439 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1040  prolyl-tRNA synthetase  70.52 
 
 		 442 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1196  prolyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 		 441 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1375  prolyl-tRNA synthetase  77.12 
 
 		 444 aa  705    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.178803  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2812  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 445 aa  910    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.165648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3276  prolyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 438 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4463  prolyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 440 aa  625  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1371  prolyl-tRNA synthetase  68.64 
 
 		 440 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4144  prolyl-tRNA synthetase  69.95 
 
 		 443 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.490189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2041  prolyl-tRNA synthetase  68.26 
 
 		 441 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4408  prolyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 444 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.619461  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1279  prolyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 		 440 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193601  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1001  prolyl-tRNA synthetase  70.56 
 
 		 441 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0568909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0701  prolyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 440 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2405  prolyl-tRNA synthetase  67.57 
 
 		 442 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1739  prolyl-tRNA synthetase  66.97 
 
 		 498 aa  613  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.350453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0816  prolyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 		 442 aa  611  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0822  prolyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 442 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.912404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0918  prolyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 442 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0794  prolyl-tRNA synthetase  65.68 
 
 		 441 aa  598  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.500422  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2434  prolyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 445 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969516  normal  0.0343641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0778  prolyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0401  prolyl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 445 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0744  prolyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 		 445 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2347  prolyl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 437 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.191545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1299  prolyl-tRNA synthetase  64.61 
 
 		 450 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1852  prolyl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.116732 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0939  prolyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 437 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1060  prolyl-tRNA synthetase  60.53 
 
 		 452 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3343  prolyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0813  prolyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0327  prolyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00684631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0740  prolyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.944832  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0367  prolyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0860  prolyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0222231  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0574  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 581 aa  305  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.579261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 570 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  63.35 
 
 		 585 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 572 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 568 aa  302  8.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3289  prolyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 		 571 aa  302  8.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.605586  normal  0.115302 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0218  prolyl-tRNA synthetase  55.76 
 
 		 580 aa  302  9e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.230302 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 576 aa  302  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2952  prolyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 573 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3251  prolyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 569 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.836053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 570 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  63.35 
 
 		 571 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 573 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  63.8 
 
 		 569 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3130  prolyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 584 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00382866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2864  prolyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 570 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  65.14 
 
 		 571 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 571 aa  299  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0200  prolyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 580 aa  300  5e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.74262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1410  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 570 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0841701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 570 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 578 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1398  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 570 aa  299  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.259821  normal  0.232568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1227  prolyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 582 aa  299  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.463936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 573 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3154  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 570 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  59.58 
 
 		 569 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 570 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  63.3 
 
 		 571 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 573 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 571 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 578 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 571 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2816  prolyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 574 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  63.35 
 
 		 564 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  63.35 
 
 		 566 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4010  prolyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 571 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02965  prolyl-tRNA synthetase  59.92 
 
 		 572 aa  296  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.33689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 571 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 578 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 571 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 578 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 		 578 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0513  prolyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 578 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3443  prolyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 578 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0201735  hitchhiker  0.00179562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0517  prolyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  62.9 
 
 		 571 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1274  prolyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 580 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.37743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  61.54 
 
 		 571 aa  294  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0846  prolyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 581 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.889779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  64.25 
 
 		 577 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>