More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2324 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  66.76 
 
 
1047 aa  1444    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.86 
 
 
1047 aa  1444    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 
1077 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  47.03 
 
 
1045 aa  956    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  57.76 
 
 
1047 aa  1246    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.91 
 
 
1053 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.72 
 
 
1070 aa  1420    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  72.02 
 
 
1052 aa  1508    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  67.46 
 
 
1048 aa  1444    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  53.94 
 
 
1059 aa  1115    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  55.5 
 
 
1066 aa  1118    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  57.38 
 
 
1045 aa  1241    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  71.22 
 
 
1047 aa  1484    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  65.13 
 
 
1038 aa  1372    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  52.53 
 
 
1061 aa  1052    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  68.76 
 
 
1068 aa  1436    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  58.75 
 
 
1052 aa  1234    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  41.89 
 
 
1049 aa  850    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  56.61 
 
 
1045 aa  1225    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  57.38 
 
 
1045 aa  1219    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  37.26 
 
 
1053 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  67.82 
 
 
1070 aa  1422    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  38.31 
 
 
1077 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  48.51 
 
 
1047 aa  999    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.86 
 
 
1049 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.57 
 
 
1052 aa  645    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  37.65 
 
 
1054 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  37.48 
 
 
1028 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  58.89 
 
 
1040 aa  1248    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  57.32 
 
 
1039 aa  1201    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  53.95 
 
 
1051 aa  1122    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  54.94 
 
 
1044 aa  1127    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  73.08 
 
 
1039 aa  1533    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  37.58 
 
 
1075 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  37.04 
 
 
1059 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  72.12 
 
 
1060 aa  1520    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  45.93 
 
 
1046 aa  931    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  55.34 
 
 
1058 aa  1085    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  67.7 
 
 
1070 aa  1414    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  38.5 
 
 
1077 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  57.38 
 
 
1045 aa  1234    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 
1077 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  70.34 
 
 
1063 aa  1501    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  55.6 
 
 
1067 aa  1151    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49.29 
 
 
1074 aa  987    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  73.08 
 
 
1056 aa  1548    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 
1050 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  53.67 
 
 
1074 aa  1157    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.3 
 
 
1070 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  46.36 
 
 
1045 aa  978    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  45.33 
 
 
1100 aa  884    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  56.32 
 
 
1054 aa  1163    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  58.14 
 
 
1042 aa  1261    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  69.08 
 
 
1068 aa  1451    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  43.25 
 
 
1015 aa  851    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  71.03 
 
 
1055 aa  1493    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  50.53 
 
 
1059 aa  1062    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  45.7 
 
 
1091 aa  924    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  38.5 
 
 
1077 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  38.97 
 
 
1077 aa  671    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  45.88 
 
 
1094 aa  943    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  54.41 
 
 
1051 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  55.46 
 
 
1047 aa  1209    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  53.38 
 
 
1043 aa  1131    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  58.87 
 
 
1039 aa  1257    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.82 
 
 
1070 aa  1422    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  46.35 
 
 
1045 aa  959    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  58.11 
 
 
1042 aa  1209    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  54.7 
 
 
1052 aa  1115    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.72 
 
 
1070 aa  1420    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  37.3 
 
 
1040 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 
1046 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  70.81 
 
 
1056 aa  1491    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.84 
 
 
1083 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  55.95 
 
 
1042 aa  1204    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  38.24 
 
 
1054 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  54.87 
 
 
1043 aa  1097    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.82 
 
 
1070 aa  1422    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 
1077 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  54.33 
 
 
1060 aa  1100    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  54.51 
 
 
1065 aa  1107    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  38.5 
 
 
1077 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  58.58 
 
 
1048 aa  1240    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  54.36 
 
 
1060 aa  1075    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  53.75 
 
 
1043 aa  1116    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  67.82 
 
 
1070 aa  1422    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  71.8 
 
 
1056 aa  1494    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  57.47 
 
 
1049 aa  1247    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  37.88 
 
 
1043 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  71.05 
 
 
1055 aa  1508    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  73.26 
 
 
1044 aa  1534    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  75 
 
 
1044 aa  1576    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  37.2 
 
 
1070 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  76.66 
 
 
1047 aa  1628    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  57.57 
 
 
1045 aa  1246    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  37.2 
 
 
1070 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  68.76 
 
 
1068 aa  1436    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  60.53 
 
 
1056 aa  1279    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  56.94 
 
 
1045 aa  1193    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  56.02 
 
 
1058 aa  1118    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>