More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0721 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 369 aa  727    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 372 aa  414  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  56.99 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  56.32 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  55.62 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  55.71 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  54.4 
 
 		 594 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 370 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  55.07 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  54.1 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  53.74 
 
 		 375 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  54.52 
 
 		 378 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  53.33 
 
 		 383 aa  357  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  54.14 
 
 		 370 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  52.17 
 
 		 376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  53.57 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  52.32 
 
 		 591 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  54.7 
 
 		 385 aa  353  2e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  52.19 
 
 		 376 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  52.34 
 
 		 593 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  53.99 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  53.41 
 
 		 378 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  53.41 
 
 		 378 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  52.47 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 615 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  53.07 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  52.04 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  51.94 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  52.32 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  53.95 
 
 		 383 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  51.67 
 
 		 381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  52.23 
 
 		 371 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  51.93 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  52.19 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  53.13 
 
 		 383 aa  333  4e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  53.91 
 
 		 379 aa  329  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  53.53 
 
 		 579 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  51.92 
 
 		 374 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  53.8 
 
 		 579 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  53.8 
 
 		 604 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  50.82 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  50.28 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  50.27 
 
 		 552 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  48.63 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  49.05 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  50.55 
 
 		 370 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2762  3-dehydroquinate synthase  50.97 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  49.17 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  50.7 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 358 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2714  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 359 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0871906  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 359 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  49.44 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  48.63 
 
 		 368 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  52.3 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  47.8 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  49.04 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  48 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  47.25 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  47.79 
 
 		 368 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 359 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  47.96 
 
 		 365 aa  308  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  49.58 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  48.62 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  48.19 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  44.75 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  47.89 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 		 365 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  46.63 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  46.13 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  46.15 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  46.41 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  49.42 
 
 		 362 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 		 365 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  49.17 
 
 		 359 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  47.5 
 
 		 359 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  47.24 
 
 		 376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  47.41 
 
 		 363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  44.72 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  46.96 
 
 		 365 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 359 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  46.52 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  48.17 
 
 		 358 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  44.44 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>