More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0485 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
726 aa  1469    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.52 
 
 
711 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
719 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.49 
 
 
677 aa  533  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
905 aa  251  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
880 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
1211 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
911 aa  228  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
944 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
1017 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
1014 aa  220  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
511 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
508 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
509 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
1174 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
815 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
884 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
725 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
722 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
885 aa  181  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
508 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
958 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 
1319 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
701 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 
3470 aa  170  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
612 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 
2153 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
1043 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
556 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  30.03 
 
 
581 aa  161  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  30.68 
 
 
595 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
1060 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
1207 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 
1021 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
430 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
556 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  30.3 
 
 
595 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
755 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.35 
 
 
581 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  34.38 
 
 
516 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
933 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
899 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  27.17 
 
 
762 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
392 aa  154  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
754 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
581 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
1064 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
695 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
2783 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
758 aa  151  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
546 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.87 
 
 
461 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 
893 aa  150  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  34.87 
 
 
461 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
718 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
393 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0979  two component sensor histidine kinase  27.59 
 
 
550 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.325763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
396 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.04 
 
 
679 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
555 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
899 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
392 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.1 
 
 
461 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  34.1 
 
 
464 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  27.46 
 
 
1111 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
639 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  29.89 
 
 
596 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
639 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
641 aa  144  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.3 
 
 
617 aa  144  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  27.75 
 
 
595 aa  144  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
634 aa  143  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
639 aa  144  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 
2161 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
748 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
608 aa  142  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
431 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
620 aa  140  7e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  28.03 
 
 
689 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
431 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
458 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
840 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  28.02 
 
 
595 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
687 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1002 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  27.36 
 
 
962 aa  138  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
906 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
763 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
638 aa  137  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
593 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  26.68 
 
 
565 aa  137  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
566 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
588 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
431 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
556 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>